Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVT8

TMUB1, Transmembrane and ubiquitin-like domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 246 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMUB1Q9BVT8 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMUB1Q9BVT8 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMUB1Q9BVT8 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMUB1Q9BVT8 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMUB1Q9BVT8 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMUB1Q9BVT8 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
TMUB1Q9BVT8 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMUB1Q9BVT8 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
TMUB1Q9BVT8 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMUB1Q9BVT8 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMUB1Q9BVT8 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
TMUB1Q9BVT8 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMUB1Q9BVT8 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMUB1Q9BVT8 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMUB1Q9BVT8 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMUB1Q9BVT8 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMUB1Q9BVT8 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMUB1Q9BVT8 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMUB1Q9BVT8 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMUB1Q9BVT8 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMUB1Q9BVT8 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMUB1Q9BVT8 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMUB1Q9BVT8 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMUB1Q9BVT8 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMUB1Q9BVT8 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMUB1Q9BVT8 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMUB1Q9BVT8 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMUB1Q9BVT8 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMUB1Q9BVT8 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMUB1Q9BVT8 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
TMUB1Q9BVT8 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
TMUB1Q9BVT8 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMUB1Q9BVT8 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMUB1Q9BVT8 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMUB1Q9BVT8 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMUB1Q9BVT8 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMUB1Q9BVT8 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMUB1Q9BVT8 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMUB1Q9BVT8 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMUB1Q9BVT8 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMUB1Q9BVT8 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMUB1Q9BVT8 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMUB1Q9BVT8 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMUB1Q9BVT8 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMUB1Q9BVT8 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMUB1Q9BVT8 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMUB1Q9BVT8 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMUB1Q9BVT8 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMUB1Q9BVT8 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMUB1Q9BVT8 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMUB1Q9BVT8 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMUB1Q9BVT8 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMUB1Q9BVT8 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
TMUB1Q9BVT8 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMUB1Q9BVT8 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TMUB1Q9BVT8 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TMUB1Q9BVT8 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TMUB1Q9BVT8 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMUB1Q9BVT8 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMUB1Q9BVT8 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMUB1Q9BVT8 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMUB1Q9BVT8 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMUB1Q9BVT8 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMUB1Q9BVT8 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMUB1Q9BVT8 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMUB1Q9BVT8 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TMUB1Q9BVT8 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TMUB1Q9BVT8 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMUB1Q9BVT8 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TMUB1Q9BVT8 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMUB1Q9BVT8 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMUB1Q9BVT8 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMUB1Q9BVT8 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMUB1Q9BVT8 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMUB1Q9BVT8 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMUB1Q9BVT8 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMUB1Q9BVT8 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMUB1Q9BVT8 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMUB1Q9BVT8 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TMUB1Q9BVT8 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMUB1Q9BVT8 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMUB1Q9BVT8 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMUB1Q9BVT8 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMUB1Q9BVT8 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMUB1Q9BVT8 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMUB1Q9BVT8 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMUB1Q9BVT8 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMUB1Q9BVT8 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMUB1Q9BVT8 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMUB1Q9BVT8 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMUB1Q9BVT8 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMUB1Q9BVT8 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMUB1Q9BVT8 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMUB1Q9BVT8 ARL4AP4-201ENST00000434170 518 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
TMUB1Q9BVT8 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMUB1Q9BVT8 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMUB1Q9BVT8 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMUB1Q9BVT8 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
TMUB1Q9BVT8 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMUB1Q9BVT8 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61 ms