Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVG4

PBDC1, Protein PBDC1, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PBDC1Q9BVG4 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PBDC1Q9BVG4 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PBDC1Q9BVG4 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PBDC1Q9BVG4 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PBDC1Q9BVG4 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PBDC1Q9BVG4 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PBDC1Q9BVG4 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PBDC1Q9BVG4 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PBDC1Q9BVG4 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PBDC1Q9BVG4 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PBDC1Q9BVG4 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PBDC1Q9BVG4 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PBDC1Q9BVG4 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PBDC1Q9BVG4 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PBDC1Q9BVG4 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PBDC1Q9BVG4 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PBDC1Q9BVG4 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PBDC1Q9BVG4 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PBDC1Q9BVG4 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PBDC1Q9BVG4 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PBDC1Q9BVG4 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PBDC1Q9BVG4 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PBDC1Q9BVG4 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PBDC1Q9BVG4 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PBDC1Q9BVG4 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PBDC1Q9BVG4 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PBDC1Q9BVG4 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PBDC1Q9BVG4 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PBDC1Q9BVG4 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PBDC1Q9BVG4 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PBDC1Q9BVG4 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PBDC1Q9BVG4 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PBDC1Q9BVG4 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PBDC1Q9BVG4 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PBDC1Q9BVG4 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PBDC1Q9BVG4 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PBDC1Q9BVG4 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PBDC1Q9BVG4 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PBDC1Q9BVG4 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PBDC1Q9BVG4 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PBDC1Q9BVG4 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PBDC1Q9BVG4 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PBDC1Q9BVG4 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PBDC1Q9BVG4 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PBDC1Q9BVG4 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PBDC1Q9BVG4 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PBDC1Q9BVG4 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PBDC1Q9BVG4 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PBDC1Q9BVG4 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PBDC1Q9BVG4 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PBDC1Q9BVG4 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
PBDC1Q9BVG4 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PBDC1Q9BVG4 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
PBDC1Q9BVG4 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PBDC1Q9BVG4 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
PBDC1Q9BVG4 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PBDC1Q9BVG4 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
PBDC1Q9BVG4 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PBDC1Q9BVG4 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PBDC1Q9BVG4 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PBDC1Q9BVG4 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PBDC1Q9BVG4 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PBDC1Q9BVG4 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PBDC1Q9BVG4 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PBDC1Q9BVG4 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PBDC1Q9BVG4 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PBDC1Q9BVG4 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PBDC1Q9BVG4 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PBDC1Q9BVG4 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PBDC1Q9BVG4 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PBDC1Q9BVG4 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PBDC1Q9BVG4 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PBDC1Q9BVG4 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PBDC1Q9BVG4 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PBDC1Q9BVG4 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PBDC1Q9BVG4 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PBDC1Q9BVG4 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PBDC1Q9BVG4 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PBDC1Q9BVG4 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PBDC1Q9BVG4 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PBDC1Q9BVG4 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PBDC1Q9BVG4 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PBDC1Q9BVG4 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PBDC1Q9BVG4 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PBDC1Q9BVG4 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PBDC1Q9BVG4 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PBDC1Q9BVG4 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PBDC1Q9BVG4 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PBDC1Q9BVG4 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PBDC1Q9BVG4 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PBDC1Q9BVG4 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PBDC1Q9BVG4 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PBDC1Q9BVG4 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PBDC1Q9BVG4 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PBDC1Q9BVG4 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PBDC1Q9BVG4 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PBDC1Q9BVG4 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PBDC1Q9BVG4 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PBDC1Q9BVG4 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PBDC1Q9BVG4 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms