Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUI4

POLR3C, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR3CQ9BUI4 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
POLR3CQ9BUI4 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
POLR3CQ9BUI4 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
POLR3CQ9BUI4 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
POLR3CQ9BUI4 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
POLR3CQ9BUI4 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
POLR3CQ9BUI4 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
POLR3CQ9BUI4 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC21.14■□□□□ 0.97
POLR3CQ9BUI4 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
POLR3CQ9BUI4 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
POLR3CQ9BUI4 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
POLR3CQ9BUI4 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
POLR3CQ9BUI4 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
POLR3CQ9BUI4 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
POLR3CQ9BUI4 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
POLR3CQ9BUI4 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
POLR3CQ9BUI4 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
POLR3CQ9BUI4 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
POLR3CQ9BUI4 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
POLR3CQ9BUI4 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
POLR3CQ9BUI4 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
POLR3CQ9BUI4 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
POLR3CQ9BUI4 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
POLR3CQ9BUI4 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
POLR3CQ9BUI4 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
POLR3CQ9BUI4 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
POLR3CQ9BUI4 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
POLR3CQ9BUI4 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
POLR3CQ9BUI4 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
POLR3CQ9BUI4 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
POLR3CQ9BUI4 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
POLR3CQ9BUI4 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
POLR3CQ9BUI4 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
POLR3CQ9BUI4 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
POLR3CQ9BUI4 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
POLR3CQ9BUI4 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
POLR3CQ9BUI4 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
POLR3CQ9BUI4 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
POLR3CQ9BUI4 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
POLR3CQ9BUI4 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
POLR3CQ9BUI4 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
POLR3CQ9BUI4 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
POLR3CQ9BUI4 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
POLR3CQ9BUI4 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
POLR3CQ9BUI4 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
POLR3CQ9BUI4 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
POLR3CQ9BUI4 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
POLR3CQ9BUI4 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
POLR3CQ9BUI4 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
POLR3CQ9BUI4 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
POLR3CQ9BUI4 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
POLR3CQ9BUI4 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
POLR3CQ9BUI4 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
POLR3CQ9BUI4 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
POLR3CQ9BUI4 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
POLR3CQ9BUI4 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
POLR3CQ9BUI4 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
POLR3CQ9BUI4 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
POLR3CQ9BUI4 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
POLR3CQ9BUI4 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
POLR3CQ9BUI4 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
POLR3CQ9BUI4 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
POLR3CQ9BUI4 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
POLR3CQ9BUI4 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
POLR3CQ9BUI4 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
POLR3CQ9BUI4 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
POLR3CQ9BUI4 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
POLR3CQ9BUI4 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
POLR3CQ9BUI4 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
POLR3CQ9BUI4 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
POLR3CQ9BUI4 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
POLR3CQ9BUI4 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
POLR3CQ9BUI4 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
POLR3CQ9BUI4 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
POLR3CQ9BUI4 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
POLR3CQ9BUI4 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
POLR3CQ9BUI4 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
POLR3CQ9BUI4 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
POLR3CQ9BUI4 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
POLR3CQ9BUI4 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
POLR3CQ9BUI4 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
POLR3CQ9BUI4 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
POLR3CQ9BUI4 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
POLR3CQ9BUI4 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
POLR3CQ9BUI4 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
POLR3CQ9BUI4 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
POLR3CQ9BUI4 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
POLR3CQ9BUI4 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
POLR3CQ9BUI4 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
POLR3CQ9BUI4 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
POLR3CQ9BUI4 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
POLR3CQ9BUI4 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
POLR3CQ9BUI4 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
POLR3CQ9BUI4 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
POLR3CQ9BUI4 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
POLR3CQ9BUI4 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
POLR3CQ9BUI4 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
POLR3CQ9BUI4 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
POLR3CQ9BUI4 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
POLR3CQ9BUI4 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.6 ms