Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRS8

LARP6, La-related protein 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 491 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LARP6Q9BRS8 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LARP6Q9BRS8 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC22.45■■□□□ 1.19
LARP6Q9BRS8 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
LARP6Q9BRS8 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
LARP6Q9BRS8 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LARP6Q9BRS8 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LARP6Q9BRS8 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LARP6Q9BRS8 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LARP6Q9BRS8 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LARP6Q9BRS8 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
LARP6Q9BRS8 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LARP6Q9BRS8 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LARP6Q9BRS8 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LARP6Q9BRS8 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LARP6Q9BRS8 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LARP6Q9BRS8 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LARP6Q9BRS8 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LARP6Q9BRS8 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LARP6Q9BRS8 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LARP6Q9BRS8 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LARP6Q9BRS8 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LARP6Q9BRS8 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LARP6Q9BRS8 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LARP6Q9BRS8 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LARP6Q9BRS8 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LARP6Q9BRS8 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LARP6Q9BRS8 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LARP6Q9BRS8 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LARP6Q9BRS8 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LARP6Q9BRS8 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LARP6Q9BRS8 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LARP6Q9BRS8 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LARP6Q9BRS8 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LARP6Q9BRS8 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LARP6Q9BRS8 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LARP6Q9BRS8 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LARP6Q9BRS8 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LARP6Q9BRS8 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LARP6Q9BRS8 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LARP6Q9BRS8 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LARP6Q9BRS8 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LARP6Q9BRS8 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LARP6Q9BRS8 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LARP6Q9BRS8 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LARP6Q9BRS8 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LARP6Q9BRS8 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LARP6Q9BRS8 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LARP6Q9BRS8 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LARP6Q9BRS8 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LARP6Q9BRS8 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LARP6Q9BRS8 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LARP6Q9BRS8 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LARP6Q9BRS8 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LARP6Q9BRS8 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LARP6Q9BRS8 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LARP6Q9BRS8 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LARP6Q9BRS8 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LARP6Q9BRS8 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LARP6Q9BRS8 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LARP6Q9BRS8 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LARP6Q9BRS8 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LARP6Q9BRS8 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LARP6Q9BRS8 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
LARP6Q9BRS8 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LARP6Q9BRS8 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
LARP6Q9BRS8 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LARP6Q9BRS8 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LARP6Q9BRS8 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LARP6Q9BRS8 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LARP6Q9BRS8 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LARP6Q9BRS8 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
LARP6Q9BRS8 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LARP6Q9BRS8 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LARP6Q9BRS8 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LARP6Q9BRS8 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LARP6Q9BRS8 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LARP6Q9BRS8 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LARP6Q9BRS8 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LARP6Q9BRS8 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
LARP6Q9BRS8 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LARP6Q9BRS8 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LARP6Q9BRS8 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LARP6Q9BRS8 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LARP6Q9BRS8 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LARP6Q9BRS8 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LARP6Q9BRS8 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LARP6Q9BRS8 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
LARP6Q9BRS8 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
LARP6Q9BRS8 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LARP6Q9BRS8 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LARP6Q9BRS8 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LARP6Q9BRS8 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LARP6Q9BRS8 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
LARP6Q9BRS8 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LARP6Q9BRS8 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
LARP6Q9BRS8 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LARP6Q9BRS8 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LARP6Q9BRS8 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LARP6Q9BRS8 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LARP6Q9BRS8 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms