Protein–RNA interactions for Protein: Q99766

ATP5S, ATP synthase subunit s, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5SQ99766 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATP5SQ99766 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATP5SQ99766 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATP5SQ99766 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATP5SQ99766 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATP5SQ99766 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATP5SQ99766 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATP5SQ99766 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATP5SQ99766 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATP5SQ99766 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATP5SQ99766 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATP5SQ99766 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATP5SQ99766 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATP5SQ99766 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATP5SQ99766 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATP5SQ99766 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATP5SQ99766 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATP5SQ99766 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
ATP5SQ99766 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATP5SQ99766 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATP5SQ99766 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATP5SQ99766 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
ATP5SQ99766 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATP5SQ99766 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATP5SQ99766 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATP5SQ99766 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATP5SQ99766 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATP5SQ99766 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATP5SQ99766 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATP5SQ99766 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
ATP5SQ99766 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATP5SQ99766 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATP5SQ99766 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATP5SQ99766 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATP5SQ99766 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATP5SQ99766 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATP5SQ99766 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
ATP5SQ99766 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATP5SQ99766 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATP5SQ99766 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
ATP5SQ99766 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATP5SQ99766 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATP5SQ99766 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATP5SQ99766 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATP5SQ99766 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
ATP5SQ99766 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
ATP5SQ99766 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATP5SQ99766 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATP5SQ99766 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATP5SQ99766 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATP5SQ99766 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATP5SQ99766 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATP5SQ99766 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATP5SQ99766 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATP5SQ99766 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATP5SQ99766 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATP5SQ99766 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATP5SQ99766 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATP5SQ99766 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATP5SQ99766 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATP5SQ99766 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATP5SQ99766 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATP5SQ99766 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATP5SQ99766 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATP5SQ99766 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATP5SQ99766 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATP5SQ99766 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATP5SQ99766 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATP5SQ99766 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATP5SQ99766 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATP5SQ99766 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATP5SQ99766 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATP5SQ99766 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATP5SQ99766 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATP5SQ99766 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATP5SQ99766 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATP5SQ99766 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATP5SQ99766 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATP5SQ99766 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
ATP5SQ99766 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
ATP5SQ99766 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATP5SQ99766 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATP5SQ99766 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATP5SQ99766 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATP5SQ99766 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATP5SQ99766 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATP5SQ99766 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATP5SQ99766 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATP5SQ99766 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATP5SQ99766 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATP5SQ99766 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATP5SQ99766 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATP5SQ99766 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATP5SQ99766 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ATP5SQ99766 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ATP5SQ99766 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ATP5SQ99766 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ATP5SQ99766 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ATP5SQ99766 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ATP5SQ99766 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms