Protein–RNA interactions for Protein: Q99523

SORT1, Sortilin, humanhuman

Predictions only

Length 831 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SORT1Q99523 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SORT1Q99523 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SORT1Q99523 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SORT1Q99523 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SORT1Q99523 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SORT1Q99523 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SORT1Q99523 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SORT1Q99523 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SORT1Q99523 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
SORT1Q99523 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SORT1Q99523 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SORT1Q99523 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SORT1Q99523 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SORT1Q99523 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SORT1Q99523 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SORT1Q99523 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SORT1Q99523 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SORT1Q99523 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SORT1Q99523 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SORT1Q99523 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SORT1Q99523 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SORT1Q99523 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SORT1Q99523 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SORT1Q99523 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SORT1Q99523 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SORT1Q99523 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SORT1Q99523 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SORT1Q99523 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SORT1Q99523 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
SORT1Q99523 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SORT1Q99523 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SORT1Q99523 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SORT1Q99523 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SORT1Q99523 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SORT1Q99523 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SORT1Q99523 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SORT1Q99523 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SORT1Q99523 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SORT1Q99523 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SORT1Q99523 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SORT1Q99523 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SORT1Q99523 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SORT1Q99523 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SORT1Q99523 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SORT1Q99523 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SORT1Q99523 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SORT1Q99523 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SORT1Q99523 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SORT1Q99523 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SORT1Q99523 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SORT1Q99523 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SORT1Q99523 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SORT1Q99523 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SORT1Q99523 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SORT1Q99523 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SORT1Q99523 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SORT1Q99523 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
SORT1Q99523 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SORT1Q99523 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SORT1Q99523 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SORT1Q99523 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
SORT1Q99523 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
SORT1Q99523 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SORT1Q99523 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SORT1Q99523 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SORT1Q99523 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SORT1Q99523 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SORT1Q99523 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SORT1Q99523 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SORT1Q99523 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SORT1Q99523 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SORT1Q99523 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SORT1Q99523 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SORT1Q99523 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SORT1Q99523 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SORT1Q99523 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SORT1Q99523 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SORT1Q99523 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SORT1Q99523 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SORT1Q99523 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SORT1Q99523 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SORT1Q99523 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SORT1Q99523 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SORT1Q99523 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SORT1Q99523 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SORT1Q99523 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SORT1Q99523 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SORT1Q99523 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SORT1Q99523 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SORT1Q99523 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SORT1Q99523 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SORT1Q99523 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SORT1Q99523 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SORT1Q99523 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SORT1Q99523 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SORT1Q99523 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SORT1Q99523 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SORT1Q99523 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
SORT1Q99523 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
SORT1Q99523 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms