Protein–RNA interactions for Protein: Q96SN8

CDK5RAP2, CDK5 regulatory subunit-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,893 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5RAP2Q96SN8 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CDK5RAP2Q96SN8 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDK5RAP2Q96SN8 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDK5RAP2Q96SN8 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDK5RAP2Q96SN8 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDK5RAP2Q96SN8 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDK5RAP2Q96SN8 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDK5RAP2Q96SN8 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDK5RAP2Q96SN8 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDK5RAP2Q96SN8 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDK5RAP2Q96SN8 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDK5RAP2Q96SN8 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDK5RAP2Q96SN8 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDK5RAP2Q96SN8 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CDK5RAP2Q96SN8 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDK5RAP2Q96SN8 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDK5RAP2Q96SN8 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDK5RAP2Q96SN8 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDK5RAP2Q96SN8 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDK5RAP2Q96SN8 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDK5RAP2Q96SN8 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDK5RAP2Q96SN8 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDK5RAP2Q96SN8 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDK5RAP2Q96SN8 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDK5RAP2Q96SN8 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDK5RAP2Q96SN8 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDK5RAP2Q96SN8 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDK5RAP2Q96SN8 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDK5RAP2Q96SN8 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CDK5RAP2Q96SN8 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDK5RAP2Q96SN8 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDK5RAP2Q96SN8 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDK5RAP2Q96SN8 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDK5RAP2Q96SN8 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDK5RAP2Q96SN8 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDK5RAP2Q96SN8 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CDK5RAP2Q96SN8 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CDK5RAP2Q96SN8 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CDK5RAP2Q96SN8 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CDK5RAP2Q96SN8 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CDK5RAP2Q96SN8 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CDK5RAP2Q96SN8 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CDK5RAP2Q96SN8 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CDK5RAP2Q96SN8 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CDK5RAP2Q96SN8 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CDK5RAP2Q96SN8 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CDK5RAP2Q96SN8 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CDK5RAP2Q96SN8 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CDK5RAP2Q96SN8 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CDK5RAP2Q96SN8 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CDK5RAP2Q96SN8 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDK5RAP2Q96SN8 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDK5RAP2Q96SN8 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDK5RAP2Q96SN8 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDK5RAP2Q96SN8 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDK5RAP2Q96SN8 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDK5RAP2Q96SN8 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDK5RAP2Q96SN8 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CDK5RAP2Q96SN8 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDK5RAP2Q96SN8 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDK5RAP2Q96SN8 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDK5RAP2Q96SN8 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDK5RAP2Q96SN8 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDK5RAP2Q96SN8 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDK5RAP2Q96SN8 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDK5RAP2Q96SN8 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDK5RAP2Q96SN8 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDK5RAP2Q96SN8 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDK5RAP2Q96SN8 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDK5RAP2Q96SN8 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CDK5RAP2Q96SN8 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDK5RAP2Q96SN8 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDK5RAP2Q96SN8 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDK5RAP2Q96SN8 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDK5RAP2Q96SN8 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDK5RAP2Q96SN8 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDK5RAP2Q96SN8 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDK5RAP2Q96SN8 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDK5RAP2Q96SN8 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDK5RAP2Q96SN8 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDK5RAP2Q96SN8 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDK5RAP2Q96SN8 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CDK5RAP2Q96SN8 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDK5RAP2Q96SN8 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CDK5RAP2Q96SN8 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CDK5RAP2Q96SN8 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDK5RAP2Q96SN8 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDK5RAP2Q96SN8 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDK5RAP2Q96SN8 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDK5RAP2Q96SN8 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDK5RAP2Q96SN8 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDK5RAP2Q96SN8 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CDK5RAP2Q96SN8 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDK5RAP2Q96SN8 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDK5RAP2Q96SN8 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDK5RAP2Q96SN8 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDK5RAP2Q96SN8 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CDK5RAP2Q96SN8 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDK5RAP2Q96SN8 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDK5RAP2Q96SN8 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms