Protein–RNA interactions for Protein: Q96RV3

PCNX1, Pecanex-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,341 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCNX1Q96RV3 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PCNX1Q96RV3 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PCNX1Q96RV3 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PCNX1Q96RV3 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PCNX1Q96RV3 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PCNX1Q96RV3 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PCNX1Q96RV3 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PCNX1Q96RV3 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PCNX1Q96RV3 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PCNX1Q96RV3 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PCNX1Q96RV3 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PCNX1Q96RV3 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PCNX1Q96RV3 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PCNX1Q96RV3 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PCNX1Q96RV3 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PCNX1Q96RV3 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PCNX1Q96RV3 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PCNX1Q96RV3 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PCNX1Q96RV3 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
PCNX1Q96RV3 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PCNX1Q96RV3 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PCNX1Q96RV3 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PCNX1Q96RV3 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PCNX1Q96RV3 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PCNX1Q96RV3 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PCNX1Q96RV3 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PCNX1Q96RV3 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PCNX1Q96RV3 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
PCNX1Q96RV3 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PCNX1Q96RV3 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PCNX1Q96RV3 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PCNX1Q96RV3 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PCNX1Q96RV3 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PCNX1Q96RV3 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PCNX1Q96RV3 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PCNX1Q96RV3 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PCNX1Q96RV3 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PCNX1Q96RV3 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PCNX1Q96RV3 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PCNX1Q96RV3 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PCNX1Q96RV3 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PCNX1Q96RV3 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PCNX1Q96RV3 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PCNX1Q96RV3 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PCNX1Q96RV3 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
PCNX1Q96RV3 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PCNX1Q96RV3 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PCNX1Q96RV3 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PCNX1Q96RV3 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PCNX1Q96RV3 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
PCNX1Q96RV3 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PCNX1Q96RV3 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
PCNX1Q96RV3 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
PCNX1Q96RV3 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PCNX1Q96RV3 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PCNX1Q96RV3 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PCNX1Q96RV3 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PCNX1Q96RV3 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PCNX1Q96RV3 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PCNX1Q96RV3 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PCNX1Q96RV3 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PCNX1Q96RV3 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PCNX1Q96RV3 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PCNX1Q96RV3 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PCNX1Q96RV3 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PCNX1Q96RV3 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PCNX1Q96RV3 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
PCNX1Q96RV3 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PCNX1Q96RV3 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PCNX1Q96RV3 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PCNX1Q96RV3 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PCNX1Q96RV3 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PCNX1Q96RV3 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PCNX1Q96RV3 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PCNX1Q96RV3 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PCNX1Q96RV3 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PCNX1Q96RV3 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PCNX1Q96RV3 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PCNX1Q96RV3 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
PCNX1Q96RV3 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PCNX1Q96RV3 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PCNX1Q96RV3 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PCNX1Q96RV3 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PCNX1Q96RV3 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PCNX1Q96RV3 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
PCNX1Q96RV3 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PCNX1Q96RV3 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
PCNX1Q96RV3 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
PCNX1Q96RV3 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
PCNX1Q96RV3 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PCNX1Q96RV3 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PCNX1Q96RV3 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PCNX1Q96RV3 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PCNX1Q96RV3 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PCNX1Q96RV3 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PCNX1Q96RV3 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PCNX1Q96RV3 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PCNX1Q96RV3 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
PCNX1Q96RV3 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PCNX1Q96RV3 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
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