Protein–RNA interactions for Protein: Q96PX6

CCDC85A, Coiled-coil domain-containing protein 85A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85AQ96PX6 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC85AQ96PX6 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC85AQ96PX6 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC85AQ96PX6 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC85AQ96PX6 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC85AQ96PX6 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC85AQ96PX6 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC85AQ96PX6 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC85AQ96PX6 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC85AQ96PX6 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC85AQ96PX6 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC85AQ96PX6 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC85AQ96PX6 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC85AQ96PX6 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC85AQ96PX6 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC85AQ96PX6 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC85AQ96PX6 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC85AQ96PX6 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC85AQ96PX6 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC85AQ96PX6 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC85AQ96PX6 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC85AQ96PX6 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC85AQ96PX6 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC85AQ96PX6 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC85AQ96PX6 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC85AQ96PX6 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC85AQ96PX6 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC85AQ96PX6 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC85AQ96PX6 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC85AQ96PX6 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC85AQ96PX6 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC85AQ96PX6 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC85AQ96PX6 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC85AQ96PX6 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC85AQ96PX6 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC85AQ96PX6 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC85AQ96PX6 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC85AQ96PX6 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC85AQ96PX6 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC85AQ96PX6 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC85AQ96PX6 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC85AQ96PX6 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC85AQ96PX6 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC85AQ96PX6 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC85AQ96PX6 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC85AQ96PX6 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC85AQ96PX6 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC85AQ96PX6 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC85AQ96PX6 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC85AQ96PX6 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC85AQ96PX6 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC85AQ96PX6 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC85AQ96PX6 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC85AQ96PX6 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC85AQ96PX6 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC85AQ96PX6 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC85AQ96PX6 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC85AQ96PX6 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC85AQ96PX6 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC85AQ96PX6 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC85AQ96PX6 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC85AQ96PX6 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC85AQ96PX6 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC85AQ96PX6 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC85AQ96PX6 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC85AQ96PX6 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC85AQ96PX6 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC85AQ96PX6 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC85AQ96PX6 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC85AQ96PX6 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC85AQ96PX6 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC85AQ96PX6 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC85AQ96PX6 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC85AQ96PX6 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC85AQ96PX6 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC85AQ96PX6 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC85AQ96PX6 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC85AQ96PX6 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC85AQ96PX6 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC85AQ96PX6 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC85AQ96PX6 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC85AQ96PX6 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC85AQ96PX6 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC85AQ96PX6 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC85AQ96PX6 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC85AQ96PX6 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC85AQ96PX6 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC85AQ96PX6 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC85AQ96PX6 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC85AQ96PX6 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC85AQ96PX6 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC85AQ96PX6 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC85AQ96PX6 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC85AQ96PX6 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC85AQ96PX6 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC85AQ96PX6 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC85AQ96PX6 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC85AQ96PX6 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC85AQ96PX6 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC85AQ96PX6 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms