Protein–RNA interactions for Protein: Q96PP9

GBP4, Guanylate-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBP4Q96PP9 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GBP4Q96PP9 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GBP4Q96PP9 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GBP4Q96PP9 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GBP4Q96PP9 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GBP4Q96PP9 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GBP4Q96PP9 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GBP4Q96PP9 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GBP4Q96PP9 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GBP4Q96PP9 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GBP4Q96PP9 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GBP4Q96PP9 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GBP4Q96PP9 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GBP4Q96PP9 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GBP4Q96PP9 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GBP4Q96PP9 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GBP4Q96PP9 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GBP4Q96PP9 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GBP4Q96PP9 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GBP4Q96PP9 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GBP4Q96PP9 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
GBP4Q96PP9 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
GBP4Q96PP9 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
GBP4Q96PP9 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
GBP4Q96PP9 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GBP4Q96PP9 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GBP4Q96PP9 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GBP4Q96PP9 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GBP4Q96PP9 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GBP4Q96PP9 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
GBP4Q96PP9 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GBP4Q96PP9 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GBP4Q96PP9 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
GBP4Q96PP9 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GBP4Q96PP9 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GBP4Q96PP9 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GBP4Q96PP9 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GBP4Q96PP9 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GBP4Q96PP9 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GBP4Q96PP9 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GBP4Q96PP9 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GBP4Q96PP9 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GBP4Q96PP9 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GBP4Q96PP9 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GBP4Q96PP9 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GBP4Q96PP9 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GBP4Q96PP9 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GBP4Q96PP9 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GBP4Q96PP9 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GBP4Q96PP9 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GBP4Q96PP9 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GBP4Q96PP9 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GBP4Q96PP9 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GBP4Q96PP9 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GBP4Q96PP9 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GBP4Q96PP9 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GBP4Q96PP9 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GBP4Q96PP9 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GBP4Q96PP9 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GBP4Q96PP9 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GBP4Q96PP9 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GBP4Q96PP9 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GBP4Q96PP9 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GBP4Q96PP9 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GBP4Q96PP9 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GBP4Q96PP9 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GBP4Q96PP9 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GBP4Q96PP9 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GBP4Q96PP9 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GBP4Q96PP9 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GBP4Q96PP9 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GBP4Q96PP9 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GBP4Q96PP9 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GBP4Q96PP9 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GBP4Q96PP9 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GBP4Q96PP9 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GBP4Q96PP9 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GBP4Q96PP9 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GBP4Q96PP9 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GBP4Q96PP9 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GBP4Q96PP9 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GBP4Q96PP9 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GBP4Q96PP9 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GBP4Q96PP9 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GBP4Q96PP9 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GBP4Q96PP9 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GBP4Q96PP9 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GBP4Q96PP9 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GBP4Q96PP9 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GBP4Q96PP9 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GBP4Q96PP9 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GBP4Q96PP9 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GBP4Q96PP9 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GBP4Q96PP9 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GBP4Q96PP9 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GBP4Q96PP9 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
GBP4Q96PP9 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GBP4Q96PP9 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GBP4Q96PP9 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GBP4Q96PP9 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms