Protein–RNA interactions for Protein: Q96J66

ABCC11, ATP-binding cassette sub-family C member 11, humanhuman

Predictions only

Length 1,382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC11Q96J66 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ABCC11Q96J66 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
ABCC11Q96J66 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC26.44■■□□□ 1.82
ABCC11Q96J66 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ABCC11Q96J66 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
ABCC11Q96J66 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
ABCC11Q96J66 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
ABCC11Q96J66 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ABCC11Q96J66 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ABCC11Q96J66 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ABCC11Q96J66 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
ABCC11Q96J66 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
ABCC11Q96J66 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ABCC11Q96J66 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ABCC11Q96J66 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
ABCC11Q96J66 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ABCC11Q96J66 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
ABCC11Q96J66 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ABCC11Q96J66 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ABCC11Q96J66 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
ABCC11Q96J66 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ABCC11Q96J66 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ABCC11Q96J66 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ABCC11Q96J66 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
ABCC11Q96J66 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
ABCC11Q96J66 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
ABCC11Q96J66 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
ABCC11Q96J66 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
ABCC11Q96J66 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ABCC11Q96J66 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ABCC11Q96J66 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ABCC11Q96J66 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ABCC11Q96J66 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ABCC11Q96J66 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ABCC11Q96J66 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ABCC11Q96J66 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
ABCC11Q96J66 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
ABCC11Q96J66 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
ABCC11Q96J66 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ABCC11Q96J66 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ABCC11Q96J66 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
ABCC11Q96J66 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
ABCC11Q96J66 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
ABCC11Q96J66 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
ABCC11Q96J66 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
ABCC11Q96J66 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
ABCC11Q96J66 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ABCC11Q96J66 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
ABCC11Q96J66 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC26.42■■□□□ 1.82
ABCC11Q96J66 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ABCC11Q96J66 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
ABCC11Q96J66 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ABCC11Q96J66 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
ABCC11Q96J66 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
ABCC11Q96J66 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
ABCC11Q96J66 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ABCC11Q96J66 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
ABCC11Q96J66 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
ABCC11Q96J66 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ABCC11Q96J66 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ABCC11Q96J66 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
ABCC11Q96J66 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
ABCC11Q96J66 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
ABCC11Q96J66 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
ABCC11Q96J66 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
ABCC11Q96J66 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
ABCC11Q96J66 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
ABCC11Q96J66 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
ABCC11Q96J66 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
ABCC11Q96J66 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
ABCC11Q96J66 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
ABCC11Q96J66 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
ABCC11Q96J66 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
ABCC11Q96J66 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC26.4■■□□□ 1.82
ABCC11Q96J66 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
ABCC11Q96J66 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
ABCC11Q96J66 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
ABCC11Q96J66 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
ABCC11Q96J66 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
ABCC11Q96J66 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
ABCC11Q96J66 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
ABCC11Q96J66 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
ABCC11Q96J66 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
ABCC11Q96J66 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
ABCC11Q96J66 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
ABCC11Q96J66 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
ABCC11Q96J66 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
ABCC11Q96J66 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
ABCC11Q96J66 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
ABCC11Q96J66 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
ABCC11Q96J66 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
ABCC11Q96J66 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
ABCC11Q96J66 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
ABCC11Q96J66 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
ABCC11Q96J66 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
ABCC11Q96J66 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
ABCC11Q96J66 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
ABCC11Q96J66 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
ABCC11Q96J66 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
ABCC11Q96J66 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms