Protein–RNA interactions for Protein: Q96A61

TRIM52, Tripartite motif-containing protein 52, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM52Q96A61 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
TRIM52Q96A61 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC28.07■■■□□ 2.08
TRIM52Q96A61 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC28.07■■■□□ 2.08
TRIM52Q96A61 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
TRIM52Q96A61 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
TRIM52Q96A61 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
TRIM52Q96A61 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
TRIM52Q96A61 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
TRIM52Q96A61 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
TRIM52Q96A61 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
TRIM52Q96A61 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
TRIM52Q96A61 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
TRIM52Q96A61 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC28.07■■■□□ 2.08
TRIM52Q96A61 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
TRIM52Q96A61 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
TRIM52Q96A61 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
TRIM52Q96A61 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
TRIM52Q96A61 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
TRIM52Q96A61 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
TRIM52Q96A61 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
TRIM52Q96A61 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC28.06■■■□□ 2.08
TRIM52Q96A61 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
TRIM52Q96A61 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
TRIM52Q96A61 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
TRIM52Q96A61 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
TRIM52Q96A61 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
TRIM52Q96A61 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
TRIM52Q96A61 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
TRIM52Q96A61 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
TRIM52Q96A61 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
TRIM52Q96A61 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
TRIM52Q96A61 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
TRIM52Q96A61 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
TRIM52Q96A61 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
TRIM52Q96A61 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
TRIM52Q96A61 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
TRIM52Q96A61 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
TRIM52Q96A61 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
TRIM52Q96A61 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
TRIM52Q96A61 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
TRIM52Q96A61 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
TRIM52Q96A61 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
TRIM52Q96A61 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
TRIM52Q96A61 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
TRIM52Q96A61 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
TRIM52Q96A61 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
TRIM52Q96A61 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
TRIM52Q96A61 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
TRIM52Q96A61 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC28.05■■■□□ 2.08
TRIM52Q96A61 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
TRIM52Q96A61 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
TRIM52Q96A61 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
TRIM52Q96A61 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
TRIM52Q96A61 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
TRIM52Q96A61 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
TRIM52Q96A61 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
TRIM52Q96A61 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
TRIM52Q96A61 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
TRIM52Q96A61 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
TRIM52Q96A61 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
TRIM52Q96A61 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
TRIM52Q96A61 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
TRIM52Q96A61 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
TRIM52Q96A61 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
TRIM52Q96A61 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
TRIM52Q96A61 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
TRIM52Q96A61 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
TRIM52Q96A61 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
TRIM52Q96A61 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC28.04■■■□□ 2.08
TRIM52Q96A61 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
TRIM52Q96A61 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
TRIM52Q96A61 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
TRIM52Q96A61 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
TRIM52Q96A61 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
TRIM52Q96A61 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
TRIM52Q96A61 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
TRIM52Q96A61 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
TRIM52Q96A61 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
TRIM52Q96A61 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
TRIM52Q96A61 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
TRIM52Q96A61 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
TRIM52Q96A61 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC28.03■■■□□ 2.08
TRIM52Q96A61 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
TRIM52Q96A61 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
TRIM52Q96A61 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
TRIM52Q96A61 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
TRIM52Q96A61 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
TRIM52Q96A61 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
TRIM52Q96A61 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
TRIM52Q96A61 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
TRIM52Q96A61 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TRIM52Q96A61 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
TRIM52Q96A61 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
TRIM52Q96A61 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TRIM52Q96A61 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TRIM52Q96A61 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TRIM52Q96A61 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TRIM52Q96A61 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
TRIM52Q96A61 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TRIM52Q96A61 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms