Protein–RNA interactions for Protein: Q96A19

CCDC102A, Coiled-coil domain-containing protein 102A, humanhuman

Predictions only

Length 550 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC102AQ96A19 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC102AQ96A19 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC102AQ96A19 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC102AQ96A19 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC102AQ96A19 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
CCDC102AQ96A19 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
CCDC102AQ96A19 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
CCDC102AQ96A19 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
CCDC102AQ96A19 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
CCDC102AQ96A19 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC102AQ96A19 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC102AQ96A19 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC102AQ96A19 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC102AQ96A19 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC102AQ96A19 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC102AQ96A19 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC102AQ96A19 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC102AQ96A19 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC102AQ96A19 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC102AQ96A19 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC102AQ96A19 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC102AQ96A19 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC102AQ96A19 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC102AQ96A19 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC102AQ96A19 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC102AQ96A19 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC102AQ96A19 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC102AQ96A19 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC102AQ96A19 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC102AQ96A19 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC102AQ96A19 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC102AQ96A19 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC102AQ96A19 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC102AQ96A19 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC102AQ96A19 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC102AQ96A19 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC102AQ96A19 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC102AQ96A19 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC102AQ96A19 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC102AQ96A19 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC102AQ96A19 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC102AQ96A19 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC102AQ96A19 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC102AQ96A19 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC102AQ96A19 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC102AQ96A19 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC102AQ96A19 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC102AQ96A19 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC102AQ96A19 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC102AQ96A19 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC102AQ96A19 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC102AQ96A19 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC102AQ96A19 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC102AQ96A19 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC102AQ96A19 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC102AQ96A19 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC102AQ96A19 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC102AQ96A19 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC102AQ96A19 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC102AQ96A19 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC102AQ96A19 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC102AQ96A19 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC102AQ96A19 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC102AQ96A19 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC102AQ96A19 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC102AQ96A19 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC102AQ96A19 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC102AQ96A19 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC102AQ96A19 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC102AQ96A19 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC102AQ96A19 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC102AQ96A19 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC102AQ96A19 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC102AQ96A19 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC102AQ96A19 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC102AQ96A19 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC102AQ96A19 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC102AQ96A19 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC102AQ96A19 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC102AQ96A19 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC102AQ96A19 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC102AQ96A19 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC102AQ96A19 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC102AQ96A19 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC102AQ96A19 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC102AQ96A19 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC102AQ96A19 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC102AQ96A19 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC102AQ96A19 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC102AQ96A19 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC102AQ96A19 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC102AQ96A19 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC102AQ96A19 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC102AQ96A19 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC102AQ96A19 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC102AQ96A19 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC102AQ96A19 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC102AQ96A19 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC102AQ96A19 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC102AQ96A19 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms