Protein–RNA interactions for Protein: Q92879

CELF1, CUGBP Elav-like family member 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 486 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CELF1Q92879 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
CELF1Q92879 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CELF1Q92879 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CELF1Q92879 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CELF1Q92879 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CELF1Q92879 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CELF1Q92879 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CELF1Q92879 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
CELF1Q92879 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CELF1Q92879 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CELF1Q92879 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CELF1Q92879 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CELF1Q92879 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CELF1Q92879 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CELF1Q92879 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CELF1Q92879 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CELF1Q92879 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CELF1Q92879 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CELF1Q92879 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CELF1Q92879 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CELF1Q92879 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CELF1Q92879 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CELF1Q92879 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CELF1Q92879 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CELF1Q92879 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CELF1Q92879 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CELF1Q92879 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CELF1Q92879 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CELF1Q92879 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CELF1Q92879 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CELF1Q92879 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CELF1Q92879 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CELF1Q92879 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CELF1Q92879 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CELF1Q92879 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CELF1Q92879 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CELF1Q92879 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CELF1Q92879 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CELF1Q92879 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CELF1Q92879 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CELF1Q92879 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
CELF1Q92879 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CELF1Q92879 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
CELF1Q92879 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CELF1Q92879 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CELF1Q92879 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CELF1Q92879 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CELF1Q92879 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CELF1Q92879 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CELF1Q92879 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
CELF1Q92879 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CELF1Q92879 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CELF1Q92879 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
CELF1Q92879 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
CELF1Q92879 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CELF1Q92879 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CELF1Q92879 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CELF1Q92879 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CELF1Q92879 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CELF1Q92879 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CELF1Q92879 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CELF1Q92879 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CELF1Q92879 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CELF1Q92879 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CELF1Q92879 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CELF1Q92879 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CELF1Q92879 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CELF1Q92879 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CELF1Q92879 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CELF1Q92879 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CELF1Q92879 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CELF1Q92879 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CELF1Q92879 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CELF1Q92879 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CELF1Q92879 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CELF1Q92879 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
CELF1Q92879 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CELF1Q92879 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
CELF1Q92879 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CELF1Q92879 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CELF1Q92879 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CELF1Q92879 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CELF1Q92879 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CELF1Q92879 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CELF1Q92879 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CELF1Q92879 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CELF1Q92879 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CELF1Q92879 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CELF1Q92879 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CELF1Q92879 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CELF1Q92879 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CELF1Q92879 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CELF1Q92879 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CELF1Q92879 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CELF1Q92879 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
CELF1Q92879 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CELF1Q92879 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CELF1Q92879 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CELF1Q92879 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CELF1Q92879 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.8 ms