Protein–RNA interactions for Protein: Q92837

FRAT1, Proto-oncogene FRAT1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 279 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRAT1Q92837 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
FRAT1Q92837 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
FRAT1Q92837 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
FRAT1Q92837 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
FRAT1Q92837 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
FRAT1Q92837 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
FRAT1Q92837 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
FRAT1Q92837 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
FRAT1Q92837 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
FRAT1Q92837 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
FRAT1Q92837 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
FRAT1Q92837 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
FRAT1Q92837 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
FRAT1Q92837 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
FRAT1Q92837 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
FRAT1Q92837 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
FRAT1Q92837 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
FRAT1Q92837 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
FRAT1Q92837 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
FRAT1Q92837 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
FRAT1Q92837 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
FRAT1Q92837 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
FRAT1Q92837 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
FRAT1Q92837 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
FRAT1Q92837 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
FRAT1Q92837 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
FRAT1Q92837 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
FRAT1Q92837 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
FRAT1Q92837 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
FRAT1Q92837 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
FRAT1Q92837 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
FRAT1Q92837 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
FRAT1Q92837 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
FRAT1Q92837 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
FRAT1Q92837 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
FRAT1Q92837 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
FRAT1Q92837 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
FRAT1Q92837 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
FRAT1Q92837 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
FRAT1Q92837 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
FRAT1Q92837 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
FRAT1Q92837 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
FRAT1Q92837 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
FRAT1Q92837 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
FRAT1Q92837 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
FRAT1Q92837 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
FRAT1Q92837 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
FRAT1Q92837 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
FRAT1Q92837 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
FRAT1Q92837 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
FRAT1Q92837 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
FRAT1Q92837 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
FRAT1Q92837 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
FRAT1Q92837 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
FRAT1Q92837 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
FRAT1Q92837 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
FRAT1Q92837 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
FRAT1Q92837 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
FRAT1Q92837 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
FRAT1Q92837 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
FRAT1Q92837 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
FRAT1Q92837 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
FRAT1Q92837 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
FRAT1Q92837 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
FRAT1Q92837 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
FRAT1Q92837 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
FRAT1Q92837 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
FRAT1Q92837 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
FRAT1Q92837 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
FRAT1Q92837 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
FRAT1Q92837 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
FRAT1Q92837 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC24.42■■□□□ 1.5
FRAT1Q92837 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
FRAT1Q92837 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
FRAT1Q92837 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
FRAT1Q92837 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
FRAT1Q92837 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
FRAT1Q92837 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
FRAT1Q92837 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
FRAT1Q92837 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
FRAT1Q92837 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
FRAT1Q92837 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
FRAT1Q92837 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
FRAT1Q92837 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
FRAT1Q92837 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
FRAT1Q92837 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
FRAT1Q92837 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
FRAT1Q92837 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
FRAT1Q92837 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
FRAT1Q92837 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
FRAT1Q92837 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
FRAT1Q92837 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
FRAT1Q92837 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC24.41■■□□□ 1.5
FRAT1Q92837 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
FRAT1Q92837 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
FRAT1Q92837 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC24.41■■□□□ 1.5
FRAT1Q92837 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
FRAT1Q92837 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
FRAT1Q92837 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
FRAT1Q92837 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms