Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDN7

ACER1, Alkaline ceramidase 1, humanhuman

Predictions only

Length 264 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACER1Q8TDN7 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ACER1Q8TDN7 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
ACER1Q8TDN7 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ACER1Q8TDN7 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ACER1Q8TDN7 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
ACER1Q8TDN7 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ACER1Q8TDN7 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ACER1Q8TDN7 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ACER1Q8TDN7 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ACER1Q8TDN7 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ACER1Q8TDN7 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ACER1Q8TDN7 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ACER1Q8TDN7 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ACER1Q8TDN7 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ACER1Q8TDN7 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ACER1Q8TDN7 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ACER1Q8TDN7 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ACER1Q8TDN7 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ACER1Q8TDN7 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ACER1Q8TDN7 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ACER1Q8TDN7 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ACER1Q8TDN7 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ACER1Q8TDN7 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ACER1Q8TDN7 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ACER1Q8TDN7 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ACER1Q8TDN7 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ACER1Q8TDN7 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ACER1Q8TDN7 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ACER1Q8TDN7 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ACER1Q8TDN7 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
ACER1Q8TDN7 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ACER1Q8TDN7 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ACER1Q8TDN7 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ACER1Q8TDN7 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ACER1Q8TDN7 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ACER1Q8TDN7 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ACER1Q8TDN7 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ACER1Q8TDN7 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ACER1Q8TDN7 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ACER1Q8TDN7 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ACER1Q8TDN7 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ACER1Q8TDN7 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ACER1Q8TDN7 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ACER1Q8TDN7 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ACER1Q8TDN7 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ACER1Q8TDN7 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ACER1Q8TDN7 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ACER1Q8TDN7 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ACER1Q8TDN7 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ACER1Q8TDN7 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ACER1Q8TDN7 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ACER1Q8TDN7 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ACER1Q8TDN7 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ACER1Q8TDN7 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ACER1Q8TDN7 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ACER1Q8TDN7 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ACER1Q8TDN7 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ACER1Q8TDN7 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ACER1Q8TDN7 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ACER1Q8TDN7 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ACER1Q8TDN7 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ACER1Q8TDN7 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ACER1Q8TDN7 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ACER1Q8TDN7 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ACER1Q8TDN7 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ACER1Q8TDN7 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ACER1Q8TDN7 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ACER1Q8TDN7 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ACER1Q8TDN7 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ACER1Q8TDN7 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ACER1Q8TDN7 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ACER1Q8TDN7 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ACER1Q8TDN7 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ACER1Q8TDN7 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
ACER1Q8TDN7 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ACER1Q8TDN7 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ACER1Q8TDN7 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ACER1Q8TDN7 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
ACER1Q8TDN7 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
ACER1Q8TDN7 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ACER1Q8TDN7 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ACER1Q8TDN7 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ACER1Q8TDN7 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ACER1Q8TDN7 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ACER1Q8TDN7 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ACER1Q8TDN7 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ACER1Q8TDN7 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ACER1Q8TDN7 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
ACER1Q8TDN7 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
ACER1Q8TDN7 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
ACER1Q8TDN7 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ACER1Q8TDN7 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ACER1Q8TDN7 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ACER1Q8TDN7 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ACER1Q8TDN7 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ACER1Q8TDN7 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ACER1Q8TDN7 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ACER1Q8TDN7 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ACER1Q8TDN7 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ACER1Q8TDN7 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms