Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEV1

CSNK2A3, Casein kinase II subunit alpha 3, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK2A3Q8NEV1 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CSNK2A3Q8NEV1 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CSNK2A3Q8NEV1 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CSNK2A3Q8NEV1 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CSNK2A3Q8NEV1 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CSNK2A3Q8NEV1 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CSNK2A3Q8NEV1 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CSNK2A3Q8NEV1 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CSNK2A3Q8NEV1 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CSNK2A3Q8NEV1 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CSNK2A3Q8NEV1 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CSNK2A3Q8NEV1 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CSNK2A3Q8NEV1 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CSNK2A3Q8NEV1 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CSNK2A3Q8NEV1 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CSNK2A3Q8NEV1 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CSNK2A3Q8NEV1 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CSNK2A3Q8NEV1 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CSNK2A3Q8NEV1 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CSNK2A3Q8NEV1 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CSNK2A3Q8NEV1 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CSNK2A3Q8NEV1 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CSNK2A3Q8NEV1 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CSNK2A3Q8NEV1 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CSNK2A3Q8NEV1 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CSNK2A3Q8NEV1 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CSNK2A3Q8NEV1 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CSNK2A3Q8NEV1 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CSNK2A3Q8NEV1 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CSNK2A3Q8NEV1 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CSNK2A3Q8NEV1 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CSNK2A3Q8NEV1 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CSNK2A3Q8NEV1 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CSNK2A3Q8NEV1 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CSNK2A3Q8NEV1 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CSNK2A3Q8NEV1 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CSNK2A3Q8NEV1 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CSNK2A3Q8NEV1 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CSNK2A3Q8NEV1 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CSNK2A3Q8NEV1 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CSNK2A3Q8NEV1 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CSNK2A3Q8NEV1 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CSNK2A3Q8NEV1 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CSNK2A3Q8NEV1 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CSNK2A3Q8NEV1 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CSNK2A3Q8NEV1 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CSNK2A3Q8NEV1 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CSNK2A3Q8NEV1 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CSNK2A3Q8NEV1 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CSNK2A3Q8NEV1 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CSNK2A3Q8NEV1 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CSNK2A3Q8NEV1 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CSNK2A3Q8NEV1 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CSNK2A3Q8NEV1 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CSNK2A3Q8NEV1 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CSNK2A3Q8NEV1 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CSNK2A3Q8NEV1 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CSNK2A3Q8NEV1 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CSNK2A3Q8NEV1 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CSNK2A3Q8NEV1 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CSNK2A3Q8NEV1 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CSNK2A3Q8NEV1 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CSNK2A3Q8NEV1 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CSNK2A3Q8NEV1 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CSNK2A3Q8NEV1 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CSNK2A3Q8NEV1 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CSNK2A3Q8NEV1 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CSNK2A3Q8NEV1 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CSNK2A3Q8NEV1 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CSNK2A3Q8NEV1 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CSNK2A3Q8NEV1 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CSNK2A3Q8NEV1 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CSNK2A3Q8NEV1 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CSNK2A3Q8NEV1 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CSNK2A3Q8NEV1 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CSNK2A3Q8NEV1 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CSNK2A3Q8NEV1 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CSNK2A3Q8NEV1 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CSNK2A3Q8NEV1 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CSNK2A3Q8NEV1 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CSNK2A3Q8NEV1 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CSNK2A3Q8NEV1 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CSNK2A3Q8NEV1 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CSNK2A3Q8NEV1 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CSNK2A3Q8NEV1 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CSNK2A3Q8NEV1 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CSNK2A3Q8NEV1 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CSNK2A3Q8NEV1 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CSNK2A3Q8NEV1 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CSNK2A3Q8NEV1 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CSNK2A3Q8NEV1 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CSNK2A3Q8NEV1 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CSNK2A3Q8NEV1 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CSNK2A3Q8NEV1 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CSNK2A3Q8NEV1 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CSNK2A3Q8NEV1 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CSNK2A3Q8NEV1 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CSNK2A3Q8NEV1 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CSNK2A3Q8NEV1 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CSNK2A3Q8NEV1 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 136.2 ms