Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCU8

LINC00116, Uncharacterized protein encoded by LINC00116, humanhuman

Predictions only

Length 138 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00116Q8NCU8 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LINC00116Q8NCU8 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
LINC00116Q8NCU8 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LINC00116Q8NCU8 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
LINC00116Q8NCU8 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
LINC00116Q8NCU8 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
LINC00116Q8NCU8 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
LINC00116Q8NCU8 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
LINC00116Q8NCU8 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
LINC00116Q8NCU8 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LINC00116Q8NCU8 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
LINC00116Q8NCU8 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
LINC00116Q8NCU8 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LINC00116Q8NCU8 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LINC00116Q8NCU8 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
LINC00116Q8NCU8 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
LINC00116Q8NCU8 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LINC00116Q8NCU8 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
LINC00116Q8NCU8 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
LINC00116Q8NCU8 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC24.01■■□□□ 1.43
LINC00116Q8NCU8 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
LINC00116Q8NCU8 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC24.01■■□□□ 1.43
LINC00116Q8NCU8 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
LINC00116Q8NCU8 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
LINC00116Q8NCU8 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
LINC00116Q8NCU8 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
LINC00116Q8NCU8 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LINC00116Q8NCU8 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LINC00116Q8NCU8 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LINC00116Q8NCU8 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LINC00116Q8NCU8 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
LINC00116Q8NCU8 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LINC00116Q8NCU8 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LINC00116Q8NCU8 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LINC00116Q8NCU8 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LINC00116Q8NCU8 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LINC00116Q8NCU8 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
LINC00116Q8NCU8 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC24■■□□□ 1.43
LINC00116Q8NCU8 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
LINC00116Q8NCU8 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
LINC00116Q8NCU8 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LINC00116Q8NCU8 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LINC00116Q8NCU8 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LINC00116Q8NCU8 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LINC00116Q8NCU8 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LINC00116Q8NCU8 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LINC00116Q8NCU8 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LINC00116Q8NCU8 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LINC00116Q8NCU8 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LINC00116Q8NCU8 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
LINC00116Q8NCU8 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LINC00116Q8NCU8 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
LINC00116Q8NCU8 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LINC00116Q8NCU8 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
LINC00116Q8NCU8 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
LINC00116Q8NCU8 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
LINC00116Q8NCU8 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
LINC00116Q8NCU8 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LINC00116Q8NCU8 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LINC00116Q8NCU8 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LINC00116Q8NCU8 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LINC00116Q8NCU8 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LINC00116Q8NCU8 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LINC00116Q8NCU8 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LINC00116Q8NCU8 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
LINC00116Q8NCU8 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
LINC00116Q8NCU8 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
LINC00116Q8NCU8 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
LINC00116Q8NCU8 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
LINC00116Q8NCU8 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LINC00116Q8NCU8 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
LINC00116Q8NCU8 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LINC00116Q8NCU8 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LINC00116Q8NCU8 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LINC00116Q8NCU8 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LINC00116Q8NCU8 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LINC00116Q8NCU8 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
LINC00116Q8NCU8 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LINC00116Q8NCU8 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
LINC00116Q8NCU8 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
LINC00116Q8NCU8 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
LINC00116Q8NCU8 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LINC00116Q8NCU8 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
LINC00116Q8NCU8 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LINC00116Q8NCU8 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LINC00116Q8NCU8 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
LINC00116Q8NCU8 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LINC00116Q8NCU8 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
LINC00116Q8NCU8 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC23.98■■□□□ 1.43
LINC00116Q8NCU8 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LINC00116Q8NCU8 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
LINC00116Q8NCU8 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
LINC00116Q8NCU8 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LINC00116Q8NCU8 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
LINC00116Q8NCU8 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
LINC00116Q8NCU8 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
LINC00116Q8NCU8 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
LINC00116Q8NCU8 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LINC00116Q8NCU8 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
LINC00116Q8NCU8 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms