Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z404

TMC4, Transmembrane channel-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 712 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMC4Q7Z404 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
TMC4Q7Z404 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TMC4Q7Z404 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TMC4Q7Z404 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TMC4Q7Z404 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TMC4Q7Z404 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TMC4Q7Z404 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TMC4Q7Z404 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TMC4Q7Z404 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TMC4Q7Z404 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TMC4Q7Z404 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TMC4Q7Z404 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TMC4Q7Z404 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TMC4Q7Z404 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TMC4Q7Z404 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
TMC4Q7Z404 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TMC4Q7Z404 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
TMC4Q7Z404 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TMC4Q7Z404 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TMC4Q7Z404 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TMC4Q7Z404 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TMC4Q7Z404 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TMC4Q7Z404 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TMC4Q7Z404 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TMC4Q7Z404 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TMC4Q7Z404 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TMC4Q7Z404 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TMC4Q7Z404 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TMC4Q7Z404 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TMC4Q7Z404 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TMC4Q7Z404 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TMC4Q7Z404 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TMC4Q7Z404 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TMC4Q7Z404 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TMC4Q7Z404 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TMC4Q7Z404 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TMC4Q7Z404 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
TMC4Q7Z404 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TMC4Q7Z404 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TMC4Q7Z404 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TMC4Q7Z404 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TMC4Q7Z404 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TMC4Q7Z404 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TMC4Q7Z404 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TMC4Q7Z404 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TMC4Q7Z404 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
TMC4Q7Z404 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TMC4Q7Z404 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
TMC4Q7Z404 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TMC4Q7Z404 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TMC4Q7Z404 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TMC4Q7Z404 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TMC4Q7Z404 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TMC4Q7Z404 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TMC4Q7Z404 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TMC4Q7Z404 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TMC4Q7Z404 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TMC4Q7Z404 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TMC4Q7Z404 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TMC4Q7Z404 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TMC4Q7Z404 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TMC4Q7Z404 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TMC4Q7Z404 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TMC4Q7Z404 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TMC4Q7Z404 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TMC4Q7Z404 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TMC4Q7Z404 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TMC4Q7Z404 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TMC4Q7Z404 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TMC4Q7Z404 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TMC4Q7Z404 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TMC4Q7Z404 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TMC4Q7Z404 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TMC4Q7Z404 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TMC4Q7Z404 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TMC4Q7Z404 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TMC4Q7Z404 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
TMC4Q7Z404 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
TMC4Q7Z404 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TMC4Q7Z404 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TMC4Q7Z404 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
TMC4Q7Z404 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TMC4Q7Z404 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TMC4Q7Z404 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
TMC4Q7Z404 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TMC4Q7Z404 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TMC4Q7Z404 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TMC4Q7Z404 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TMC4Q7Z404 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TMC4Q7Z404 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TMC4Q7Z404 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TMC4Q7Z404 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TMC4Q7Z404 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TMC4Q7Z404 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TMC4Q7Z404 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
TMC4Q7Z404 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TMC4Q7Z404 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TMC4Q7Z404 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TMC4Q7Z404 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TMC4Q7Z404 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms