Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3C6

ATG9A, Autophagy-related protein 9A, humanhuman

Predictions only

Length 839 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG9AQ7Z3C6 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
ATG9AQ7Z3C6 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATG9AQ7Z3C6 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATG9AQ7Z3C6 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
ATG9AQ7Z3C6 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATG9AQ7Z3C6 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
ATG9AQ7Z3C6 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATG9AQ7Z3C6 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATG9AQ7Z3C6 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
ATG9AQ7Z3C6 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATG9AQ7Z3C6 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATG9AQ7Z3C6 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
ATG9AQ7Z3C6 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATG9AQ7Z3C6 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATG9AQ7Z3C6 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATG9AQ7Z3C6 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATG9AQ7Z3C6 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
ATG9AQ7Z3C6 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATG9AQ7Z3C6 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATG9AQ7Z3C6 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATG9AQ7Z3C6 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATG9AQ7Z3C6 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATG9AQ7Z3C6 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATG9AQ7Z3C6 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATG9AQ7Z3C6 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATG9AQ7Z3C6 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATG9AQ7Z3C6 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATG9AQ7Z3C6 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATG9AQ7Z3C6 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATG9AQ7Z3C6 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATG9AQ7Z3C6 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATG9AQ7Z3C6 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATG9AQ7Z3C6 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATG9AQ7Z3C6 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
ATG9AQ7Z3C6 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATG9AQ7Z3C6 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATG9AQ7Z3C6 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATG9AQ7Z3C6 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATG9AQ7Z3C6 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATG9AQ7Z3C6 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATG9AQ7Z3C6 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATG9AQ7Z3C6 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATG9AQ7Z3C6 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATG9AQ7Z3C6 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATG9AQ7Z3C6 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATG9AQ7Z3C6 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATG9AQ7Z3C6 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATG9AQ7Z3C6 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATG9AQ7Z3C6 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATG9AQ7Z3C6 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATG9AQ7Z3C6 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATG9AQ7Z3C6 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATG9AQ7Z3C6 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATG9AQ7Z3C6 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
ATG9AQ7Z3C6 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATG9AQ7Z3C6 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATG9AQ7Z3C6 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATG9AQ7Z3C6 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATG9AQ7Z3C6 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATG9AQ7Z3C6 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATG9AQ7Z3C6 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATG9AQ7Z3C6 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATG9AQ7Z3C6 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATG9AQ7Z3C6 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATG9AQ7Z3C6 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATG9AQ7Z3C6 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATG9AQ7Z3C6 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATG9AQ7Z3C6 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATG9AQ7Z3C6 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATG9AQ7Z3C6 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATG9AQ7Z3C6 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATG9AQ7Z3C6 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATG9AQ7Z3C6 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATG9AQ7Z3C6 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
ATG9AQ7Z3C6 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATG9AQ7Z3C6 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATG9AQ7Z3C6 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATG9AQ7Z3C6 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATG9AQ7Z3C6 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATG9AQ7Z3C6 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ATG9AQ7Z3C6 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ATG9AQ7Z3C6 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ATG9AQ7Z3C6 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ATG9AQ7Z3C6 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ATG9AQ7Z3C6 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ATG9AQ7Z3C6 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ATG9AQ7Z3C6 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
ATG9AQ7Z3C6 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ATG9AQ7Z3C6 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ATG9AQ7Z3C6 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ATG9AQ7Z3C6 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ATG9AQ7Z3C6 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ATG9AQ7Z3C6 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
ATG9AQ7Z3C6 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ATG9AQ7Z3C6 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ATG9AQ7Z3C6 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ATG9AQ7Z3C6 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ATG9AQ7Z3C6 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ATG9AQ7Z3C6 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ATG9AQ7Z3C6 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms