Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z333

SETX, Probable helicase senataxin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,677 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SETXQ7Z333 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SETXQ7Z333 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SETXQ7Z333 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SETXQ7Z333 IFT20-214ENST00000585089 1071 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SETXQ7Z333 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SETXQ7Z333 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SETXQ7Z333 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SETXQ7Z333 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SETXQ7Z333 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SETXQ7Z333 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SETXQ7Z333 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SETXQ7Z333 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SETXQ7Z333 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SETXQ7Z333 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SETXQ7Z333 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SETXQ7Z333 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SETXQ7Z333 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SETXQ7Z333 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SETXQ7Z333 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SETXQ7Z333 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SETXQ7Z333 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SETXQ7Z333 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SETXQ7Z333 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SETXQ7Z333 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SETXQ7Z333 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SETXQ7Z333 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SETXQ7Z333 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SETXQ7Z333 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SETXQ7Z333 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SETXQ7Z333 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SETXQ7Z333 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SETXQ7Z333 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SETXQ7Z333 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SETXQ7Z333 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SETXQ7Z333 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SETXQ7Z333 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SETXQ7Z333 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
SETXQ7Z333 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SETXQ7Z333 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SETXQ7Z333 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SETXQ7Z333 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SETXQ7Z333 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SETXQ7Z333 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SETXQ7Z333 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SETXQ7Z333 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
SETXQ7Z333 AC034102.5-201ENST00000548731 540 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SETXQ7Z333 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SETXQ7Z333 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SETXQ7Z333 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
SETXQ7Z333 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SETXQ7Z333 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SETXQ7Z333 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
SETXQ7Z333 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
SETXQ7Z333 TPT1-AS1-203ENST00000412946 744 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.18
SETXQ7Z333 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
SETXQ7Z333 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
SETXQ7Z333 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
SETXQ7Z333 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.18
SETXQ7Z333 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.18
SETXQ7Z333 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.18
SETXQ7Z333 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
SETXQ7Z333 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
SETXQ7Z333 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SETXQ7Z333 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SETXQ7Z333 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SETXQ7Z333 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SETXQ7Z333 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SETXQ7Z333 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SETXQ7Z333 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SETXQ7Z333 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
SETXQ7Z333 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SETXQ7Z333 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SETXQ7Z333 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SETXQ7Z333 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SETXQ7Z333 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SETXQ7Z333 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SETXQ7Z333 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SETXQ7Z333 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
SETXQ7Z333 AC078852.2-201ENST00000504748 527 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SETXQ7Z333 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SETXQ7Z333 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SETXQ7Z333 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SETXQ7Z333 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SETXQ7Z333 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SETXQ7Z333 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SETXQ7Z333 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SETXQ7Z333 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SETXQ7Z333 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SETXQ7Z333 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SETXQ7Z333 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SETXQ7Z333 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SETXQ7Z333 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SETXQ7Z333 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SETXQ7Z333 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SETXQ7Z333 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SETXQ7Z333 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SETXQ7Z333 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SETXQ7Z333 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SETXQ7Z333 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SETXQ7Z333 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms