Protein–RNA interactions for Protein: Q71RS6

SLC24A5, Sodium/potassium/calcium exchanger 5, humanhuman

Predictions only

Length 500 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC24A5Q71RS6 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SLC24A5Q71RS6 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SLC24A5Q71RS6 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SLC24A5Q71RS6 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SLC24A5Q71RS6 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SLC24A5Q71RS6 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SLC24A5Q71RS6 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SLC24A5Q71RS6 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SLC24A5Q71RS6 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SLC24A5Q71RS6 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SLC24A5Q71RS6 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SLC24A5Q71RS6 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SLC24A5Q71RS6 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SLC24A5Q71RS6 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SLC24A5Q71RS6 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
SLC24A5Q71RS6 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
SLC24A5Q71RS6 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
SLC24A5Q71RS6 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
SLC24A5Q71RS6 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
SLC24A5Q71RS6 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
SLC24A5Q71RS6 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC20.39■□□□□ 0.86
SLC24A5Q71RS6 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SLC24A5Q71RS6 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SLC24A5Q71RS6 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SLC24A5Q71RS6 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SLC24A5Q71RS6 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SLC24A5Q71RS6 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SLC24A5Q71RS6 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SLC24A5Q71RS6 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SLC24A5Q71RS6 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
SLC24A5Q71RS6 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
SLC24A5Q71RS6 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
SLC24A5Q71RS6 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
SLC24A5Q71RS6 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
SLC24A5Q71RS6 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SLC24A5Q71RS6 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SLC24A5Q71RS6 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SLC24A5Q71RS6 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SLC24A5Q71RS6 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SLC24A5Q71RS6 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SLC24A5Q71RS6 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SLC24A5Q71RS6 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SLC24A5Q71RS6 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SLC24A5Q71RS6 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SLC24A5Q71RS6 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SLC24A5Q71RS6 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SLC24A5Q71RS6 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SLC24A5Q71RS6 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SLC24A5Q71RS6 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
SLC24A5Q71RS6 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SLC24A5Q71RS6 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SLC24A5Q71RS6 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SLC24A5Q71RS6 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SLC24A5Q71RS6 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
SLC24A5Q71RS6 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SLC24A5Q71RS6 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SLC24A5Q71RS6 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
SLC24A5Q71RS6 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
SLC24A5Q71RS6 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SLC24A5Q71RS6 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SLC24A5Q71RS6 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SLC24A5Q71RS6 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SLC24A5Q71RS6 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SLC24A5Q71RS6 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SLC24A5Q71RS6 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SLC24A5Q71RS6 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SLC24A5Q71RS6 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SLC24A5Q71RS6 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SLC24A5Q71RS6 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SLC24A5Q71RS6 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SLC24A5Q71RS6 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SLC24A5Q71RS6 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SLC24A5Q71RS6 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SLC24A5Q71RS6 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SLC24A5Q71RS6 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SLC24A5Q71RS6 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SLC24A5Q71RS6 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
SLC24A5Q71RS6 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SLC24A5Q71RS6 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SLC24A5Q71RS6 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SLC24A5Q71RS6 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SLC24A5Q71RS6 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SLC24A5Q71RS6 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SLC24A5Q71RS6 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SLC24A5Q71RS6 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
SLC24A5Q71RS6 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SLC24A5Q71RS6 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SLC24A5Q71RS6 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SLC24A5Q71RS6 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SLC24A5Q71RS6 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SLC24A5Q71RS6 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
SLC24A5Q71RS6 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SLC24A5Q71RS6 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SLC24A5Q71RS6 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SLC24A5Q71RS6 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SLC24A5Q71RS6 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SLC24A5Q71RS6 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SLC24A5Q71RS6 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SLC24A5Q71RS6 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SLC24A5Q71RS6 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms