Protein–RNA interactions for Protein: Q71F56

MED13L, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 13-like, humanhuman

Predictions only

Length 2,210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED13LQ71F56 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MED13LQ71F56 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MED13LQ71F56 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MED13LQ71F56 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MED13LQ71F56 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MED13LQ71F56 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MED13LQ71F56 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MED13LQ71F56 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MED13LQ71F56 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MED13LQ71F56 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MED13LQ71F56 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MED13LQ71F56 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MED13LQ71F56 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MED13LQ71F56 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
MED13LQ71F56 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MED13LQ71F56 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MED13LQ71F56 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
MED13LQ71F56 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MED13LQ71F56 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MED13LQ71F56 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MED13LQ71F56 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MED13LQ71F56 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MED13LQ71F56 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MED13LQ71F56 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MED13LQ71F56 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MED13LQ71F56 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MED13LQ71F56 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MED13LQ71F56 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MED13LQ71F56 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MED13LQ71F56 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MED13LQ71F56 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MED13LQ71F56 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MED13LQ71F56 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MED13LQ71F56 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MED13LQ71F56 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MED13LQ71F56 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
MED13LQ71F56 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MED13LQ71F56 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MED13LQ71F56 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MED13LQ71F56 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MED13LQ71F56 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
MED13LQ71F56 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MED13LQ71F56 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MED13LQ71F56 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MED13LQ71F56 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MED13LQ71F56 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MED13LQ71F56 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MED13LQ71F56 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MED13LQ71F56 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MED13LQ71F56 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MED13LQ71F56 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MED13LQ71F56 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MED13LQ71F56 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MED13LQ71F56 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MED13LQ71F56 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MED13LQ71F56 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MED13LQ71F56 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MED13LQ71F56 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MED13LQ71F56 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
MED13LQ71F56 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MED13LQ71F56 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
MED13LQ71F56 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MED13LQ71F56 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
MED13LQ71F56 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MED13LQ71F56 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MED13LQ71F56 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MED13LQ71F56 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MED13LQ71F56 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MED13LQ71F56 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MED13LQ71F56 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MED13LQ71F56 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MED13LQ71F56 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MED13LQ71F56 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MED13LQ71F56 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MED13LQ71F56 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MED13LQ71F56 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MED13LQ71F56 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MED13LQ71F56 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MED13LQ71F56 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MED13LQ71F56 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MED13LQ71F56 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
MED13LQ71F56 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
MED13LQ71F56 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MED13LQ71F56 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MED13LQ71F56 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MED13LQ71F56 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MED13LQ71F56 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
MED13LQ71F56 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MED13LQ71F56 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MED13LQ71F56 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MED13LQ71F56 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MED13LQ71F56 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MED13LQ71F56 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MED13LQ71F56 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MED13LQ71F56 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MED13LQ71F56 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MED13LQ71F56 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MED13LQ71F56 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MED13LQ71F56 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MED13LQ71F56 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms