Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZT12

UBR3, E3 ubiquitin-protein ligase UBR3, humanhuman

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Length 1,888 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBR3Q6ZT12 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
UBR3Q6ZT12 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
UBR3Q6ZT12 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
UBR3Q6ZT12 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
UBR3Q6ZT12 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
UBR3Q6ZT12 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
UBR3Q6ZT12 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
UBR3Q6ZT12 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
UBR3Q6ZT12 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
UBR3Q6ZT12 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
UBR3Q6ZT12 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
UBR3Q6ZT12 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
UBR3Q6ZT12 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
UBR3Q6ZT12 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
UBR3Q6ZT12 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
UBR3Q6ZT12 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
UBR3Q6ZT12 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
UBR3Q6ZT12 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
UBR3Q6ZT12 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
UBR3Q6ZT12 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
UBR3Q6ZT12 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
UBR3Q6ZT12 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
UBR3Q6ZT12 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
UBR3Q6ZT12 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
UBR3Q6ZT12 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
UBR3Q6ZT12 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
UBR3Q6ZT12 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
UBR3Q6ZT12 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
UBR3Q6ZT12 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC23.81■■□□□ 1.4
UBR3Q6ZT12 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
UBR3Q6ZT12 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
UBR3Q6ZT12 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
UBR3Q6ZT12 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
UBR3Q6ZT12 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
UBR3Q6ZT12 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
UBR3Q6ZT12 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
UBR3Q6ZT12 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
UBR3Q6ZT12 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
UBR3Q6ZT12 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
UBR3Q6ZT12 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
UBR3Q6ZT12 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
UBR3Q6ZT12 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
UBR3Q6ZT12 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
UBR3Q6ZT12 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
UBR3Q6ZT12 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
UBR3Q6ZT12 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
UBR3Q6ZT12 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
UBR3Q6ZT12 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
UBR3Q6ZT12 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
UBR3Q6ZT12 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
UBR3Q6ZT12 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
UBR3Q6ZT12 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
UBR3Q6ZT12 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
UBR3Q6ZT12 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
UBR3Q6ZT12 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
UBR3Q6ZT12 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
UBR3Q6ZT12 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
UBR3Q6ZT12 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
UBR3Q6ZT12 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
UBR3Q6ZT12 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
UBR3Q6ZT12 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
UBR3Q6ZT12 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
UBR3Q6ZT12 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
UBR3Q6ZT12 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
UBR3Q6ZT12 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
UBR3Q6ZT12 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
UBR3Q6ZT12 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
UBR3Q6ZT12 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
UBR3Q6ZT12 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
UBR3Q6ZT12 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
UBR3Q6ZT12 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
UBR3Q6ZT12 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
UBR3Q6ZT12 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
UBR3Q6ZT12 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
UBR3Q6ZT12 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
UBR3Q6ZT12 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
UBR3Q6ZT12 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC23.77■■□□□ 1.4
UBR3Q6ZT12 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
UBR3Q6ZT12 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC23.77■■□□□ 1.4
UBR3Q6ZT12 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
UBR3Q6ZT12 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
UBR3Q6ZT12 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
UBR3Q6ZT12 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
UBR3Q6ZT12 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
UBR3Q6ZT12 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
UBR3Q6ZT12 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
UBR3Q6ZT12 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
UBR3Q6ZT12 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
UBR3Q6ZT12 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
UBR3Q6ZT12 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
UBR3Q6ZT12 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
UBR3Q6ZT12 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
UBR3Q6ZT12 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
UBR3Q6ZT12 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
UBR3Q6ZT12 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
UBR3Q6ZT12 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
UBR3Q6ZT12 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
UBR3Q6ZT12 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
UBR3Q6ZT12 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC23.76■■□□□ 1.39
UBR3Q6ZT12 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
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