Protein–RNA interactions for Protein: Q6YHK3

CD109, CD109 antigen, humanhuman

Predictions only

Length 1,445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD109Q6YHK3 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CD109Q6YHK3 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CD109Q6YHK3 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
CD109Q6YHK3 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CD109Q6YHK3 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
CD109Q6YHK3 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CD109Q6YHK3 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CD109Q6YHK3 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CD109Q6YHK3 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CD109Q6YHK3 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CD109Q6YHK3 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CD109Q6YHK3 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
CD109Q6YHK3 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CD109Q6YHK3 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CD109Q6YHK3 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CD109Q6YHK3 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CD109Q6YHK3 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CD109Q6YHK3 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CD109Q6YHK3 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CD109Q6YHK3 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CD109Q6YHK3 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CD109Q6YHK3 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CD109Q6YHK3 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CD109Q6YHK3 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CD109Q6YHK3 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
CD109Q6YHK3 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CD109Q6YHK3 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
CD109Q6YHK3 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CD109Q6YHK3 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CD109Q6YHK3 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CD109Q6YHK3 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CD109Q6YHK3 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CD109Q6YHK3 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
CD109Q6YHK3 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CD109Q6YHK3 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CD109Q6YHK3 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
CD109Q6YHK3 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CD109Q6YHK3 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CD109Q6YHK3 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CD109Q6YHK3 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CD109Q6YHK3 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CD109Q6YHK3 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CD109Q6YHK3 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
CD109Q6YHK3 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CD109Q6YHK3 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CD109Q6YHK3 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CD109Q6YHK3 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CD109Q6YHK3 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CD109Q6YHK3 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CD109Q6YHK3 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CD109Q6YHK3 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CD109Q6YHK3 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CD109Q6YHK3 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CD109Q6YHK3 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CD109Q6YHK3 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
CD109Q6YHK3 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CD109Q6YHK3 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
CD109Q6YHK3 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
CD109Q6YHK3 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CD109Q6YHK3 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
CD109Q6YHK3 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
CD109Q6YHK3 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
CD109Q6YHK3 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CD109Q6YHK3 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CD109Q6YHK3 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CD109Q6YHK3 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CD109Q6YHK3 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
CD109Q6YHK3 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CD109Q6YHK3 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
CD109Q6YHK3 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC28.81■■■□□ 2.2
CD109Q6YHK3 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
CD109Q6YHK3 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
CD109Q6YHK3 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CD109Q6YHK3 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CD109Q6YHK3 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CD109Q6YHK3 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CD109Q6YHK3 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CD109Q6YHK3 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CD109Q6YHK3 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CD109Q6YHK3 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
CD109Q6YHK3 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
CD109Q6YHK3 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
CD109Q6YHK3 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
CD109Q6YHK3 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CD109Q6YHK3 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CD109Q6YHK3 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
CD109Q6YHK3 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
CD109Q6YHK3 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CD109Q6YHK3 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC28.8■■■□□ 2.2
CD109Q6YHK3 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CD109Q6YHK3 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CD109Q6YHK3 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CD109Q6YHK3 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
CD109Q6YHK3 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CD109Q6YHK3 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CD109Q6YHK3 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
CD109Q6YHK3 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CD109Q6YHK3 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CD109Q6YHK3 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CD109Q6YHK3 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms