Protein–RNA interactions for Protein: Q6RFH8

DUX4L9, Double homeobox protein 4C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 374 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUX4L9Q6RFH8 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
DUX4L9Q6RFH8 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
DUX4L9Q6RFH8 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
DUX4L9Q6RFH8 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
DUX4L9Q6RFH8 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
DUX4L9Q6RFH8 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
DUX4L9Q6RFH8 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
DUX4L9Q6RFH8 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
DUX4L9Q6RFH8 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
DUX4L9Q6RFH8 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
DUX4L9Q6RFH8 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
DUX4L9Q6RFH8 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
DUX4L9Q6RFH8 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
DUX4L9Q6RFH8 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
DUX4L9Q6RFH8 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DUX4L9Q6RFH8 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
DUX4L9Q6RFH8 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
DUX4L9Q6RFH8 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
DUX4L9Q6RFH8 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
DUX4L9Q6RFH8 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DUX4L9Q6RFH8 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
DUX4L9Q6RFH8 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DUX4L9Q6RFH8 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
DUX4L9Q6RFH8 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DUX4L9Q6RFH8 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DUX4L9Q6RFH8 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
DUX4L9Q6RFH8 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DUX4L9Q6RFH8 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DUX4L9Q6RFH8 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
DUX4L9Q6RFH8 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
DUX4L9Q6RFH8 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
DUX4L9Q6RFH8 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
DUX4L9Q6RFH8 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
DUX4L9Q6RFH8 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
DUX4L9Q6RFH8 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
DUX4L9Q6RFH8 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
DUX4L9Q6RFH8 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DUX4L9Q6RFH8 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
DUX4L9Q6RFH8 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
DUX4L9Q6RFH8 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DUX4L9Q6RFH8 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DUX4L9Q6RFH8 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
DUX4L9Q6RFH8 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DUX4L9Q6RFH8 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DUX4L9Q6RFH8 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DUX4L9Q6RFH8 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DUX4L9Q6RFH8 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DUX4L9Q6RFH8 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DUX4L9Q6RFH8 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DUX4L9Q6RFH8 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DUX4L9Q6RFH8 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DUX4L9Q6RFH8 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DUX4L9Q6RFH8 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DUX4L9Q6RFH8 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
DUX4L9Q6RFH8 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DUX4L9Q6RFH8 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
DUX4L9Q6RFH8 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
DUX4L9Q6RFH8 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
DUX4L9Q6RFH8 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
DUX4L9Q6RFH8 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
DUX4L9Q6RFH8 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DUX4L9Q6RFH8 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DUX4L9Q6RFH8 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
DUX4L9Q6RFH8 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DUX4L9Q6RFH8 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DUX4L9Q6RFH8 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DUX4L9Q6RFH8 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
DUX4L9Q6RFH8 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DUX4L9Q6RFH8 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
DUX4L9Q6RFH8 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DUX4L9Q6RFH8 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
DUX4L9Q6RFH8 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
DUX4L9Q6RFH8 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
DUX4L9Q6RFH8 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
DUX4L9Q6RFH8 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
DUX4L9Q6RFH8 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
DUX4L9Q6RFH8 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
DUX4L9Q6RFH8 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
DUX4L9Q6RFH8 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
DUX4L9Q6RFH8 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
DUX4L9Q6RFH8 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
DUX4L9Q6RFH8 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
DUX4L9Q6RFH8 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
DUX4L9Q6RFH8 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
DUX4L9Q6RFH8 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
DUX4L9Q6RFH8 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
DUX4L9Q6RFH8 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
DUX4L9Q6RFH8 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
DUX4L9Q6RFH8 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
DUX4L9Q6RFH8 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
DUX4L9Q6RFH8 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
DUX4L9Q6RFH8 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
DUX4L9Q6RFH8 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
DUX4L9Q6RFH8 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
DUX4L9Q6RFH8 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
DUX4L9Q6RFH8 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
DUX4L9Q6RFH8 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
DUX4L9Q6RFH8 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
DUX4L9Q6RFH8 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
DUX4L9Q6RFH8 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms