Protein–RNA interactions for Protein: Q6Q0C0

TRAF7, E3 ubiquitin-protein ligase TRAF7, humanhuman

Predictions only

Length 670 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF7Q6Q0C0 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
TRAF7Q6Q0C0 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
TRAF7Q6Q0C0 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
TRAF7Q6Q0C0 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
TRAF7Q6Q0C0 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
TRAF7Q6Q0C0 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
TRAF7Q6Q0C0 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
TRAF7Q6Q0C0 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
TRAF7Q6Q0C0 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
TRAF7Q6Q0C0 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
TRAF7Q6Q0C0 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
TRAF7Q6Q0C0 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
TRAF7Q6Q0C0 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
TRAF7Q6Q0C0 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
TRAF7Q6Q0C0 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
TRAF7Q6Q0C0 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
TRAF7Q6Q0C0 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
TRAF7Q6Q0C0 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
TRAF7Q6Q0C0 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
TRAF7Q6Q0C0 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
TRAF7Q6Q0C0 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
TRAF7Q6Q0C0 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
TRAF7Q6Q0C0 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
TRAF7Q6Q0C0 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
TRAF7Q6Q0C0 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
TRAF7Q6Q0C0 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
TRAF7Q6Q0C0 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
TRAF7Q6Q0C0 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
TRAF7Q6Q0C0 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
TRAF7Q6Q0C0 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
TRAF7Q6Q0C0 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
TRAF7Q6Q0C0 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
TRAF7Q6Q0C0 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
TRAF7Q6Q0C0 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
TRAF7Q6Q0C0 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
TRAF7Q6Q0C0 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
TRAF7Q6Q0C0 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
TRAF7Q6Q0C0 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
TRAF7Q6Q0C0 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
TRAF7Q6Q0C0 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
TRAF7Q6Q0C0 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
TRAF7Q6Q0C0 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
TRAF7Q6Q0C0 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
TRAF7Q6Q0C0 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
TRAF7Q6Q0C0 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
TRAF7Q6Q0C0 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TRAF7Q6Q0C0 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TRAF7Q6Q0C0 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TRAF7Q6Q0C0 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TRAF7Q6Q0C0 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TRAF7Q6Q0C0 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TRAF7Q6Q0C0 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TRAF7Q6Q0C0 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TRAF7Q6Q0C0 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TRAF7Q6Q0C0 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TRAF7Q6Q0C0 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TRAF7Q6Q0C0 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TRAF7Q6Q0C0 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TRAF7Q6Q0C0 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TRAF7Q6Q0C0 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
TRAF7Q6Q0C0 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TRAF7Q6Q0C0 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
TRAF7Q6Q0C0 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TRAF7Q6Q0C0 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TRAF7Q6Q0C0 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
TRAF7Q6Q0C0 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TRAF7Q6Q0C0 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TRAF7Q6Q0C0 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
TRAF7Q6Q0C0 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TRAF7Q6Q0C0 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TRAF7Q6Q0C0 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TRAF7Q6Q0C0 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TRAF7Q6Q0C0 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TRAF7Q6Q0C0 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TRAF7Q6Q0C0 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TRAF7Q6Q0C0 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TRAF7Q6Q0C0 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TRAF7Q6Q0C0 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TRAF7Q6Q0C0 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TRAF7Q6Q0C0 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TRAF7Q6Q0C0 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TRAF7Q6Q0C0 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TRAF7Q6Q0C0 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TRAF7Q6Q0C0 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TRAF7Q6Q0C0 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
TRAF7Q6Q0C0 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TRAF7Q6Q0C0 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TRAF7Q6Q0C0 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TRAF7Q6Q0C0 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TRAF7Q6Q0C0 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TRAF7Q6Q0C0 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TRAF7Q6Q0C0 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TRAF7Q6Q0C0 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TRAF7Q6Q0C0 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TRAF7Q6Q0C0 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TRAF7Q6Q0C0 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TRAF7Q6Q0C0 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TRAF7Q6Q0C0 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TRAF7Q6Q0C0 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TRAF7Q6Q0C0 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms