Protein–RNA interactions for Protein: Q6NW40

RGMB, RGM domain family member B, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGMBQ6NW40 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RGMBQ6NW40 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RGMBQ6NW40 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RGMBQ6NW40 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RGMBQ6NW40 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RGMBQ6NW40 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
RGMBQ6NW40 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RGMBQ6NW40 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
RGMBQ6NW40 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RGMBQ6NW40 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RGMBQ6NW40 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RGMBQ6NW40 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RGMBQ6NW40 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RGMBQ6NW40 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RGMBQ6NW40 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RGMBQ6NW40 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RGMBQ6NW40 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RGMBQ6NW40 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RGMBQ6NW40 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RGMBQ6NW40 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RGMBQ6NW40 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RGMBQ6NW40 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
RGMBQ6NW40 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RGMBQ6NW40 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RGMBQ6NW40 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RGMBQ6NW40 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RGMBQ6NW40 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
RGMBQ6NW40 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
RGMBQ6NW40 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RGMBQ6NW40 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
RGMBQ6NW40 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
RGMBQ6NW40 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RGMBQ6NW40 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
RGMBQ6NW40 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RGMBQ6NW40 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
RGMBQ6NW40 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RGMBQ6NW40 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
RGMBQ6NW40 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RGMBQ6NW40 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RGMBQ6NW40 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RGMBQ6NW40 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RGMBQ6NW40 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RGMBQ6NW40 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
RGMBQ6NW40 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
RGMBQ6NW40 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RGMBQ6NW40 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RGMBQ6NW40 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RGMBQ6NW40 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RGMBQ6NW40 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RGMBQ6NW40 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RGMBQ6NW40 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RGMBQ6NW40 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
RGMBQ6NW40 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RGMBQ6NW40 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RGMBQ6NW40 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RGMBQ6NW40 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RGMBQ6NW40 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RGMBQ6NW40 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RGMBQ6NW40 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RGMBQ6NW40 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RGMBQ6NW40 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RGMBQ6NW40 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RGMBQ6NW40 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
RGMBQ6NW40 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RGMBQ6NW40 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
RGMBQ6NW40 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
RGMBQ6NW40 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.1
RGMBQ6NW40 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
RGMBQ6NW40 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
RGMBQ6NW40 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
RGMBQ6NW40 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
RGMBQ6NW40 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
RGMBQ6NW40 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
RGMBQ6NW40 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RGMBQ6NW40 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
RGMBQ6NW40 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RGMBQ6NW40 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC21.89■■□□□ 1.09
RGMBQ6NW40 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
RGMBQ6NW40 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
RGMBQ6NW40 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
RGMBQ6NW40 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
RGMBQ6NW40 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
RGMBQ6NW40 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
RGMBQ6NW40 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
RGMBQ6NW40 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RGMBQ6NW40 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RGMBQ6NW40 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RGMBQ6NW40 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RGMBQ6NW40 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RGMBQ6NW40 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RGMBQ6NW40 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RGMBQ6NW40 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RGMBQ6NW40 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RGMBQ6NW40 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RGMBQ6NW40 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RGMBQ6NW40 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RGMBQ6NW40 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RGMBQ6NW40 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RGMBQ6NW40 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
RGMBQ6NW40 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms