Protein–RNA interactions for Protein: Q6F5E8

CARMIL2, Capping protein, Arp2/3 and myosin-I linker protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARMIL2Q6F5E8 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
CARMIL2Q6F5E8 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
CARMIL2Q6F5E8 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
CARMIL2Q6F5E8 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
CARMIL2Q6F5E8 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC29.97■■■□□ 2.39
CARMIL2Q6F5E8 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
CARMIL2Q6F5E8 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
CARMIL2Q6F5E8 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
CARMIL2Q6F5E8 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC29.97■■■□□ 2.39
CARMIL2Q6F5E8 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
CARMIL2Q6F5E8 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
CARMIL2Q6F5E8 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
CARMIL2Q6F5E8 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
CARMIL2Q6F5E8 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
CARMIL2Q6F5E8 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
CARMIL2Q6F5E8 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
CARMIL2Q6F5E8 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
CARMIL2Q6F5E8 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC29.96■■■□□ 2.39
CARMIL2Q6F5E8 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
CARMIL2Q6F5E8 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
CARMIL2Q6F5E8 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
CARMIL2Q6F5E8 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
CARMIL2Q6F5E8 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC29.96■■■□□ 2.39
CARMIL2Q6F5E8 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
CARMIL2Q6F5E8 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
CARMIL2Q6F5E8 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
CARMIL2Q6F5E8 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC29.96■■■□□ 2.39
CARMIL2Q6F5E8 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC29.96■■■□□ 2.39
CARMIL2Q6F5E8 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
CARMIL2Q6F5E8 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
CARMIL2Q6F5E8 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
CARMIL2Q6F5E8 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.39
CARMIL2Q6F5E8 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
CARMIL2Q6F5E8 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC29.95■■■□□ 2.39
CARMIL2Q6F5E8 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.38
CARMIL2Q6F5E8 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
CARMIL2Q6F5E8 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
CARMIL2Q6F5E8 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
CARMIL2Q6F5E8 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
CARMIL2Q6F5E8 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
CARMIL2Q6F5E8 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
CARMIL2Q6F5E8 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.38
CARMIL2Q6F5E8 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC29.95■■■□□ 2.38
CARMIL2Q6F5E8 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC29.95■■■□□ 2.38
CARMIL2Q6F5E8 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC29.95■■■□□ 2.38
CARMIL2Q6F5E8 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC29.95■■■□□ 2.38
CARMIL2Q6F5E8 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.38
CARMIL2Q6F5E8 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.38
CARMIL2Q6F5E8 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
CARMIL2Q6F5E8 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
CARMIL2Q6F5E8 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
CARMIL2Q6F5E8 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
CARMIL2Q6F5E8 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
CARMIL2Q6F5E8 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
CARMIL2Q6F5E8 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
CARMIL2Q6F5E8 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.94■■■□□ 2.38
CARMIL2Q6F5E8 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC29.94■■■□□ 2.38
CARMIL2Q6F5E8 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC29.94■■■□□ 2.38
CARMIL2Q6F5E8 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
CARMIL2Q6F5E8 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC29.94■■■□□ 2.38
CARMIL2Q6F5E8 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
CARMIL2Q6F5E8 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
CARMIL2Q6F5E8 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
CARMIL2Q6F5E8 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
CARMIL2Q6F5E8 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
CARMIL2Q6F5E8 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
CARMIL2Q6F5E8 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
CARMIL2Q6F5E8 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
CARMIL2Q6F5E8 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
CARMIL2Q6F5E8 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
CARMIL2Q6F5E8 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC29.93■■■□□ 2.38
CARMIL2Q6F5E8 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
CARMIL2Q6F5E8 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
CARMIL2Q6F5E8 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC29.93■■■□□ 2.38
CARMIL2Q6F5E8 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
CARMIL2Q6F5E8 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
CARMIL2Q6F5E8 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
CARMIL2Q6F5E8 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
CARMIL2Q6F5E8 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
CARMIL2Q6F5E8 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
CARMIL2Q6F5E8 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
CARMIL2Q6F5E8 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
CARMIL2Q6F5E8 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
CARMIL2Q6F5E8 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
CARMIL2Q6F5E8 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC29.92■■■□□ 2.38
CARMIL2Q6F5E8 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
CARMIL2Q6F5E8 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
CARMIL2Q6F5E8 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
CARMIL2Q6F5E8 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
CARMIL2Q6F5E8 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
CARMIL2Q6F5E8 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
CARMIL2Q6F5E8 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
CARMIL2Q6F5E8 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
CARMIL2Q6F5E8 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
CARMIL2Q6F5E8 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
CARMIL2Q6F5E8 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
CARMIL2Q6F5E8 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC29.91■■■□□ 2.38
CARMIL2Q6F5E8 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
CARMIL2Q6F5E8 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC29.91■■■□□ 2.38
CARMIL2Q6F5E8 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC29.91■■■□□ 2.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms