Protein–RNA interactions for Protein: Q5VZ18

SHE, SH2 domain-containing adapter protein E, humanhuman

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHEQ5VZ18 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SHEQ5VZ18 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SHEQ5VZ18 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SHEQ5VZ18 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SHEQ5VZ18 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SHEQ5VZ18 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SHEQ5VZ18 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SHEQ5VZ18 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SHEQ5VZ18 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SHEQ5VZ18 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SHEQ5VZ18 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SHEQ5VZ18 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
SHEQ5VZ18 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SHEQ5VZ18 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SHEQ5VZ18 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SHEQ5VZ18 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SHEQ5VZ18 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
SHEQ5VZ18 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SHEQ5VZ18 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SHEQ5VZ18 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SHEQ5VZ18 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SHEQ5VZ18 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SHEQ5VZ18 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SHEQ5VZ18 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SHEQ5VZ18 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SHEQ5VZ18 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SHEQ5VZ18 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SHEQ5VZ18 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SHEQ5VZ18 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SHEQ5VZ18 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SHEQ5VZ18 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SHEQ5VZ18 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SHEQ5VZ18 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SHEQ5VZ18 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SHEQ5VZ18 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
SHEQ5VZ18 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SHEQ5VZ18 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SHEQ5VZ18 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SHEQ5VZ18 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SHEQ5VZ18 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SHEQ5VZ18 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SHEQ5VZ18 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SHEQ5VZ18 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SHEQ5VZ18 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SHEQ5VZ18 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SHEQ5VZ18 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SHEQ5VZ18 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SHEQ5VZ18 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SHEQ5VZ18 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SHEQ5VZ18 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SHEQ5VZ18 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
SHEQ5VZ18 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SHEQ5VZ18 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
SHEQ5VZ18 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SHEQ5VZ18 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SHEQ5VZ18 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SHEQ5VZ18 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SHEQ5VZ18 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SHEQ5VZ18 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SHEQ5VZ18 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SHEQ5VZ18 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SHEQ5VZ18 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SHEQ5VZ18 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SHEQ5VZ18 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SHEQ5VZ18 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
SHEQ5VZ18 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
SHEQ5VZ18 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SHEQ5VZ18 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SHEQ5VZ18 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
SHEQ5VZ18 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SHEQ5VZ18 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SHEQ5VZ18 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SHEQ5VZ18 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SHEQ5VZ18 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
SHEQ5VZ18 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SHEQ5VZ18 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SHEQ5VZ18 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SHEQ5VZ18 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SHEQ5VZ18 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SHEQ5VZ18 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SHEQ5VZ18 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SHEQ5VZ18 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SHEQ5VZ18 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SHEQ5VZ18 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SHEQ5VZ18 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
SHEQ5VZ18 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SHEQ5VZ18 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
SHEQ5VZ18 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SHEQ5VZ18 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SHEQ5VZ18 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SHEQ5VZ18 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SHEQ5VZ18 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
SHEQ5VZ18 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
SHEQ5VZ18 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
SHEQ5VZ18 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SHEQ5VZ18 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SHEQ5VZ18 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SHEQ5VZ18 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SHEQ5VZ18 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SHEQ5VZ18 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms