Protein–RNA interactions for Protein: Q5VX71

SUSD4, Sushi domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUSD4Q5VX71 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SUSD4Q5VX71 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SUSD4Q5VX71 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
SUSD4Q5VX71 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SUSD4Q5VX71 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SUSD4Q5VX71 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SUSD4Q5VX71 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SUSD4Q5VX71 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SUSD4Q5VX71 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SUSD4Q5VX71 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SUSD4Q5VX71 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SUSD4Q5VX71 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SUSD4Q5VX71 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SUSD4Q5VX71 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
SUSD4Q5VX71 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SUSD4Q5VX71 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SUSD4Q5VX71 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SUSD4Q5VX71 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SUSD4Q5VX71 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SUSD4Q5VX71 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SUSD4Q5VX71 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SUSD4Q5VX71 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SUSD4Q5VX71 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
SUSD4Q5VX71 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SUSD4Q5VX71 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SUSD4Q5VX71 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SUSD4Q5VX71 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
SUSD4Q5VX71 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
SUSD4Q5VX71 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SUSD4Q5VX71 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SUSD4Q5VX71 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SUSD4Q5VX71 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
SUSD4Q5VX71 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SUSD4Q5VX71 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
SUSD4Q5VX71 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SUSD4Q5VX71 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SUSD4Q5VX71 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SUSD4Q5VX71 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SUSD4Q5VX71 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
SUSD4Q5VX71 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SUSD4Q5VX71 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SUSD4Q5VX71 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SUSD4Q5VX71 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SUSD4Q5VX71 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SUSD4Q5VX71 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SUSD4Q5VX71 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SUSD4Q5VX71 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SUSD4Q5VX71 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SUSD4Q5VX71 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SUSD4Q5VX71 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SUSD4Q5VX71 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SUSD4Q5VX71 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SUSD4Q5VX71 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SUSD4Q5VX71 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SUSD4Q5VX71 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SUSD4Q5VX71 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
SUSD4Q5VX71 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SUSD4Q5VX71 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SUSD4Q5VX71 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SUSD4Q5VX71 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SUSD4Q5VX71 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SUSD4Q5VX71 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SUSD4Q5VX71 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SUSD4Q5VX71 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SUSD4Q5VX71 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SUSD4Q5VX71 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SUSD4Q5VX71 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SUSD4Q5VX71 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SUSD4Q5VX71 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SUSD4Q5VX71 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SUSD4Q5VX71 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SUSD4Q5VX71 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SUSD4Q5VX71 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SUSD4Q5VX71 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SUSD4Q5VX71 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SUSD4Q5VX71 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SUSD4Q5VX71 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SUSD4Q5VX71 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SUSD4Q5VX71 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
SUSD4Q5VX71 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
SUSD4Q5VX71 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
SUSD4Q5VX71 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SUSD4Q5VX71 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SUSD4Q5VX71 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
SUSD4Q5VX71 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SUSD4Q5VX71 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SUSD4Q5VX71 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SUSD4Q5VX71 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SUSD4Q5VX71 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SUSD4Q5VX71 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SUSD4Q5VX71 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SUSD4Q5VX71 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SUSD4Q5VX71 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SUSD4Q5VX71 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SUSD4Q5VX71 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SUSD4Q5VX71 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
SUSD4Q5VX71 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SUSD4Q5VX71 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SUSD4Q5VX71 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SUSD4Q5VX71 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms