Protein–RNA interactions for Protein: Q5VW22

AGAP6, Arf-GAP with GTPase, ANK repeat and PH domain-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 663 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGAP6Q5VW22 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
AGAP6Q5VW22 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
AGAP6Q5VW22 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
AGAP6Q5VW22 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
AGAP6Q5VW22 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
AGAP6Q5VW22 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
AGAP6Q5VW22 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
AGAP6Q5VW22 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
AGAP6Q5VW22 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
AGAP6Q5VW22 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
AGAP6Q5VW22 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
AGAP6Q5VW22 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
AGAP6Q5VW22 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
AGAP6Q5VW22 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
AGAP6Q5VW22 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
AGAP6Q5VW22 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
AGAP6Q5VW22 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
AGAP6Q5VW22 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
AGAP6Q5VW22 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
AGAP6Q5VW22 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
AGAP6Q5VW22 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
AGAP6Q5VW22 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
AGAP6Q5VW22 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
AGAP6Q5VW22 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
AGAP6Q5VW22 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
AGAP6Q5VW22 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
AGAP6Q5VW22 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
AGAP6Q5VW22 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
AGAP6Q5VW22 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
AGAP6Q5VW22 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
AGAP6Q5VW22 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
AGAP6Q5VW22 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
AGAP6Q5VW22 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
AGAP6Q5VW22 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
AGAP6Q5VW22 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
AGAP6Q5VW22 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
AGAP6Q5VW22 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
AGAP6Q5VW22 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
AGAP6Q5VW22 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
AGAP6Q5VW22 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
AGAP6Q5VW22 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
AGAP6Q5VW22 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
AGAP6Q5VW22 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
AGAP6Q5VW22 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
AGAP6Q5VW22 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
AGAP6Q5VW22 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
AGAP6Q5VW22 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
AGAP6Q5VW22 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
AGAP6Q5VW22 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
AGAP6Q5VW22 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
AGAP6Q5VW22 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
AGAP6Q5VW22 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
AGAP6Q5VW22 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
AGAP6Q5VW22 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
AGAP6Q5VW22 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
AGAP6Q5VW22 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
AGAP6Q5VW22 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
AGAP6Q5VW22 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
AGAP6Q5VW22 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
AGAP6Q5VW22 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
AGAP6Q5VW22 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
AGAP6Q5VW22 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
AGAP6Q5VW22 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
AGAP6Q5VW22 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
AGAP6Q5VW22 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
AGAP6Q5VW22 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
AGAP6Q5VW22 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
AGAP6Q5VW22 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
AGAP6Q5VW22 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
AGAP6Q5VW22 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
AGAP6Q5VW22 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
AGAP6Q5VW22 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
AGAP6Q5VW22 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
AGAP6Q5VW22 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
AGAP6Q5VW22 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
AGAP6Q5VW22 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
AGAP6Q5VW22 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
AGAP6Q5VW22 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
AGAP6Q5VW22 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
AGAP6Q5VW22 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
AGAP6Q5VW22 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
AGAP6Q5VW22 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
AGAP6Q5VW22 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
AGAP6Q5VW22 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
AGAP6Q5VW22 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
AGAP6Q5VW22 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
AGAP6Q5VW22 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
AGAP6Q5VW22 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
AGAP6Q5VW22 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
AGAP6Q5VW22 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
AGAP6Q5VW22 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
AGAP6Q5VW22 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
AGAP6Q5VW22 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
AGAP6Q5VW22 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
AGAP6Q5VW22 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
AGAP6Q5VW22 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
AGAP6Q5VW22 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
AGAP6Q5VW22 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
AGAP6Q5VW22 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
AGAP6Q5VW22 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms