Protein–RNA interactions for Protein: Q5U3C3

TMEM164, Transmembrane protein 164, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM164Q5U3C3 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TMEM164Q5U3C3 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TMEM164Q5U3C3 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TMEM164Q5U3C3 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TMEM164Q5U3C3 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TMEM164Q5U3C3 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TMEM164Q5U3C3 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TMEM164Q5U3C3 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TMEM164Q5U3C3 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TMEM164Q5U3C3 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TMEM164Q5U3C3 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TMEM164Q5U3C3 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
TMEM164Q5U3C3 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TMEM164Q5U3C3 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TMEM164Q5U3C3 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TMEM164Q5U3C3 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
TMEM164Q5U3C3 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TMEM164Q5U3C3 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TMEM164Q5U3C3 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TMEM164Q5U3C3 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TMEM164Q5U3C3 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
TMEM164Q5U3C3 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TMEM164Q5U3C3 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TMEM164Q5U3C3 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TMEM164Q5U3C3 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TMEM164Q5U3C3 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TMEM164Q5U3C3 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TMEM164Q5U3C3 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TMEM164Q5U3C3 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TMEM164Q5U3C3 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TMEM164Q5U3C3 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TMEM164Q5U3C3 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TMEM164Q5U3C3 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TMEM164Q5U3C3 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TMEM164Q5U3C3 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TMEM164Q5U3C3 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TMEM164Q5U3C3 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TMEM164Q5U3C3 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TMEM164Q5U3C3 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TMEM164Q5U3C3 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TMEM164Q5U3C3 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
TMEM164Q5U3C3 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TMEM164Q5U3C3 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TMEM164Q5U3C3 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TMEM164Q5U3C3 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TMEM164Q5U3C3 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TMEM164Q5U3C3 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TMEM164Q5U3C3 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TMEM164Q5U3C3 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TMEM164Q5U3C3 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
TMEM164Q5U3C3 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TMEM164Q5U3C3 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TMEM164Q5U3C3 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TMEM164Q5U3C3 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TMEM164Q5U3C3 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TMEM164Q5U3C3 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TMEM164Q5U3C3 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TMEM164Q5U3C3 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TMEM164Q5U3C3 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TMEM164Q5U3C3 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TMEM164Q5U3C3 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TMEM164Q5U3C3 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TMEM164Q5U3C3 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TMEM164Q5U3C3 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TMEM164Q5U3C3 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TMEM164Q5U3C3 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TMEM164Q5U3C3 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TMEM164Q5U3C3 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TMEM164Q5U3C3 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TMEM164Q5U3C3 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TMEM164Q5U3C3 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
TMEM164Q5U3C3 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TMEM164Q5U3C3 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
TMEM164Q5U3C3 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TMEM164Q5U3C3 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TMEM164Q5U3C3 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TMEM164Q5U3C3 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TMEM164Q5U3C3 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TMEM164Q5U3C3 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TMEM164Q5U3C3 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
TMEM164Q5U3C3 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TMEM164Q5U3C3 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TMEM164Q5U3C3 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TMEM164Q5U3C3 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TMEM164Q5U3C3 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TMEM164Q5U3C3 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TMEM164Q5U3C3 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
TMEM164Q5U3C3 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TMEM164Q5U3C3 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TMEM164Q5U3C3 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TMEM164Q5U3C3 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TMEM164Q5U3C3 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TMEM164Q5U3C3 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TMEM164Q5U3C3 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TMEM164Q5U3C3 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TMEM164Q5U3C3 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TMEM164Q5U3C3 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TMEM164Q5U3C3 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TMEM164Q5U3C3 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TMEM164Q5U3C3 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms