Protein–RNA interactions for Protein: Q5T700

LDLRAD1, Low-density lipoprotein receptor class A domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LDLRAD1Q5T700 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LDLRAD1Q5T700 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LDLRAD1Q5T700 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LDLRAD1Q5T700 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
LDLRAD1Q5T700 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
LDLRAD1Q5T700 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LDLRAD1Q5T700 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LDLRAD1Q5T700 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LDLRAD1Q5T700 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LDLRAD1Q5T700 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LDLRAD1Q5T700 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LDLRAD1Q5T700 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LDLRAD1Q5T700 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LDLRAD1Q5T700 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LDLRAD1Q5T700 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LDLRAD1Q5T700 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LDLRAD1Q5T700 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LDLRAD1Q5T700 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LDLRAD1Q5T700 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LDLRAD1Q5T700 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LDLRAD1Q5T700 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LDLRAD1Q5T700 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LDLRAD1Q5T700 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LDLRAD1Q5T700 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LDLRAD1Q5T700 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LDLRAD1Q5T700 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LDLRAD1Q5T700 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LDLRAD1Q5T700 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LDLRAD1Q5T700 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LDLRAD1Q5T700 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
LDLRAD1Q5T700 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LDLRAD1Q5T700 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LDLRAD1Q5T700 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LDLRAD1Q5T700 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LDLRAD1Q5T700 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LDLRAD1Q5T700 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LDLRAD1Q5T700 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LDLRAD1Q5T700 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LDLRAD1Q5T700 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LDLRAD1Q5T700 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
LDLRAD1Q5T700 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
LDLRAD1Q5T700 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
LDLRAD1Q5T700 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LDLRAD1Q5T700 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
LDLRAD1Q5T700 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LDLRAD1Q5T700 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
LDLRAD1Q5T700 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
LDLRAD1Q5T700 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
LDLRAD1Q5T700 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LDLRAD1Q5T700 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
LDLRAD1Q5T700 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LDLRAD1Q5T700 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LDLRAD1Q5T700 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
LDLRAD1Q5T700 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
LDLRAD1Q5T700 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LDLRAD1Q5T700 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LDLRAD1Q5T700 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LDLRAD1Q5T700 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
LDLRAD1Q5T700 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
LDLRAD1Q5T700 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
LDLRAD1Q5T700 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
LDLRAD1Q5T700 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
LDLRAD1Q5T700 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
LDLRAD1Q5T700 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
LDLRAD1Q5T700 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
LDLRAD1Q5T700 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LDLRAD1Q5T700 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LDLRAD1Q5T700 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LDLRAD1Q5T700 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LDLRAD1Q5T700 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
LDLRAD1Q5T700 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
LDLRAD1Q5T700 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LDLRAD1Q5T700 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LDLRAD1Q5T700 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
LDLRAD1Q5T700 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
LDLRAD1Q5T700 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
LDLRAD1Q5T700 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
LDLRAD1Q5T700 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
LDLRAD1Q5T700 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
LDLRAD1Q5T700 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
LDLRAD1Q5T700 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
LDLRAD1Q5T700 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
LDLRAD1Q5T700 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
LDLRAD1Q5T700 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
LDLRAD1Q5T700 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
LDLRAD1Q5T700 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
LDLRAD1Q5T700 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
LDLRAD1Q5T700 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
LDLRAD1Q5T700 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
LDLRAD1Q5T700 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
LDLRAD1Q5T700 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LDLRAD1Q5T700 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LDLRAD1Q5T700 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LDLRAD1Q5T700 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LDLRAD1Q5T700 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LDLRAD1Q5T700 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LDLRAD1Q5T700 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LDLRAD1Q5T700 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LDLRAD1Q5T700 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
LDLRAD1Q5T700 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms