Protein–RNA interactions for Protein: Q5T0J3

C1orf220, Putative uncharacterized protein C1orf220, humanhuman

Predictions only

Length 134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf220Q5T0J3 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
C1orf220Q5T0J3 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
C1orf220Q5T0J3 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
C1orf220Q5T0J3 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
C1orf220Q5T0J3 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
C1orf220Q5T0J3 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
C1orf220Q5T0J3 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
C1orf220Q5T0J3 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
C1orf220Q5T0J3 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
C1orf220Q5T0J3 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
C1orf220Q5T0J3 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
C1orf220Q5T0J3 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
C1orf220Q5T0J3 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
C1orf220Q5T0J3 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
C1orf220Q5T0J3 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
C1orf220Q5T0J3 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
C1orf220Q5T0J3 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
C1orf220Q5T0J3 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
C1orf220Q5T0J3 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
C1orf220Q5T0J3 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
C1orf220Q5T0J3 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
C1orf220Q5T0J3 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
C1orf220Q5T0J3 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
C1orf220Q5T0J3 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
C1orf220Q5T0J3 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
C1orf220Q5T0J3 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
C1orf220Q5T0J3 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
C1orf220Q5T0J3 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
C1orf220Q5T0J3 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
C1orf220Q5T0J3 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
C1orf220Q5T0J3 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
C1orf220Q5T0J3 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
C1orf220Q5T0J3 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
C1orf220Q5T0J3 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
C1orf220Q5T0J3 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
C1orf220Q5T0J3 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
C1orf220Q5T0J3 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
C1orf220Q5T0J3 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
C1orf220Q5T0J3 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
C1orf220Q5T0J3 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
C1orf220Q5T0J3 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
C1orf220Q5T0J3 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
C1orf220Q5T0J3 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
C1orf220Q5T0J3 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
C1orf220Q5T0J3 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
C1orf220Q5T0J3 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
C1orf220Q5T0J3 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
C1orf220Q5T0J3 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
C1orf220Q5T0J3 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
C1orf220Q5T0J3 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
C1orf220Q5T0J3 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
C1orf220Q5T0J3 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
C1orf220Q5T0J3 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
C1orf220Q5T0J3 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
C1orf220Q5T0J3 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
C1orf220Q5T0J3 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
C1orf220Q5T0J3 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
C1orf220Q5T0J3 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
C1orf220Q5T0J3 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
C1orf220Q5T0J3 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
C1orf220Q5T0J3 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
C1orf220Q5T0J3 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
C1orf220Q5T0J3 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
C1orf220Q5T0J3 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
C1orf220Q5T0J3 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
C1orf220Q5T0J3 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
C1orf220Q5T0J3 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
C1orf220Q5T0J3 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
C1orf220Q5T0J3 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
C1orf220Q5T0J3 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
C1orf220Q5T0J3 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
C1orf220Q5T0J3 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
C1orf220Q5T0J3 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
C1orf220Q5T0J3 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
C1orf220Q5T0J3 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
C1orf220Q5T0J3 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
C1orf220Q5T0J3 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
C1orf220Q5T0J3 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
C1orf220Q5T0J3 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
C1orf220Q5T0J3 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
C1orf220Q5T0J3 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
C1orf220Q5T0J3 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
C1orf220Q5T0J3 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
C1orf220Q5T0J3 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
C1orf220Q5T0J3 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
C1orf220Q5T0J3 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
C1orf220Q5T0J3 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
C1orf220Q5T0J3 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC20.39■□□□□ 0.86
C1orf220Q5T0J3 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.39■□□□□ 0.85
C1orf220Q5T0J3 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
C1orf220Q5T0J3 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
C1orf220Q5T0J3 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
C1orf220Q5T0J3 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
C1orf220Q5T0J3 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
C1orf220Q5T0J3 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
C1orf220Q5T0J3 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
C1orf220Q5T0J3 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
C1orf220Q5T0J3 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
C1orf220Q5T0J3 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
C1orf220Q5T0J3 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms