Protein–RNA interactions for Protein: Q5RGS3

FAM74A1, Protein FAM74A1, humanhuman

Predictions only

Length 127 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM74A1Q5RGS3 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FAM74A1Q5RGS3 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FAM74A1Q5RGS3 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FAM74A1Q5RGS3 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FAM74A1Q5RGS3 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
FAM74A1Q5RGS3 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FAM74A1Q5RGS3 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FAM74A1Q5RGS3 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FAM74A1Q5RGS3 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FAM74A1Q5RGS3 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FAM74A1Q5RGS3 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FAM74A1Q5RGS3 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FAM74A1Q5RGS3 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FAM74A1Q5RGS3 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FAM74A1Q5RGS3 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FAM74A1Q5RGS3 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FAM74A1Q5RGS3 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FAM74A1Q5RGS3 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FAM74A1Q5RGS3 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FAM74A1Q5RGS3 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FAM74A1Q5RGS3 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FAM74A1Q5RGS3 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FAM74A1Q5RGS3 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FAM74A1Q5RGS3 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FAM74A1Q5RGS3 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FAM74A1Q5RGS3 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FAM74A1Q5RGS3 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FAM74A1Q5RGS3 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
FAM74A1Q5RGS3 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FAM74A1Q5RGS3 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FAM74A1Q5RGS3 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FAM74A1Q5RGS3 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FAM74A1Q5RGS3 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FAM74A1Q5RGS3 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FAM74A1Q5RGS3 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FAM74A1Q5RGS3 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FAM74A1Q5RGS3 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FAM74A1Q5RGS3 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FAM74A1Q5RGS3 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FAM74A1Q5RGS3 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FAM74A1Q5RGS3 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FAM74A1Q5RGS3 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FAM74A1Q5RGS3 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FAM74A1Q5RGS3 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FAM74A1Q5RGS3 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FAM74A1Q5RGS3 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FAM74A1Q5RGS3 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FAM74A1Q5RGS3 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FAM74A1Q5RGS3 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FAM74A1Q5RGS3 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FAM74A1Q5RGS3 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FAM74A1Q5RGS3 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FAM74A1Q5RGS3 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM74A1Q5RGS3 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM74A1Q5RGS3 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM74A1Q5RGS3 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM74A1Q5RGS3 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM74A1Q5RGS3 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM74A1Q5RGS3 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM74A1Q5RGS3 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM74A1Q5RGS3 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM74A1Q5RGS3 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM74A1Q5RGS3 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM74A1Q5RGS3 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM74A1Q5RGS3 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM74A1Q5RGS3 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM74A1Q5RGS3 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM74A1Q5RGS3 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM74A1Q5RGS3 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM74A1Q5RGS3 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM74A1Q5RGS3 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM74A1Q5RGS3 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM74A1Q5RGS3 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM74A1Q5RGS3 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM74A1Q5RGS3 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM74A1Q5RGS3 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM74A1Q5RGS3 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM74A1Q5RGS3 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM74A1Q5RGS3 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM74A1Q5RGS3 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM74A1Q5RGS3 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM74A1Q5RGS3 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM74A1Q5RGS3 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM74A1Q5RGS3 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM74A1Q5RGS3 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM74A1Q5RGS3 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FAM74A1Q5RGS3 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FAM74A1Q5RGS3 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FAM74A1Q5RGS3 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FAM74A1Q5RGS3 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FAM74A1Q5RGS3 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FAM74A1Q5RGS3 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FAM74A1Q5RGS3 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FAM74A1Q5RGS3 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FAM74A1Q5RGS3 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FAM74A1Q5RGS3 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FAM74A1Q5RGS3 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FAM74A1Q5RGS3 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FAM74A1Q5RGS3 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FAM74A1Q5RGS3 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms