Protein–RNA interactions for Protein: Q5M9N0

CCDC158, Coiled-coil domain-containing protein 158, humanhuman

Predictions only

Length 1,113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC158Q5M9N0 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC158Q5M9N0 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC158Q5M9N0 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC158Q5M9N0 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC158Q5M9N0 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC158Q5M9N0 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC158Q5M9N0 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC158Q5M9N0 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC158Q5M9N0 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC158Q5M9N0 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC158Q5M9N0 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC158Q5M9N0 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC158Q5M9N0 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC158Q5M9N0 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC158Q5M9N0 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC158Q5M9N0 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC158Q5M9N0 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC158Q5M9N0 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC158Q5M9N0 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC158Q5M9N0 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC158Q5M9N0 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC158Q5M9N0 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC158Q5M9N0 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC158Q5M9N0 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC158Q5M9N0 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC158Q5M9N0 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC158Q5M9N0 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC158Q5M9N0 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC158Q5M9N0 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC158Q5M9N0 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC158Q5M9N0 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC158Q5M9N0 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC158Q5M9N0 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC158Q5M9N0 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC158Q5M9N0 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC158Q5M9N0 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC158Q5M9N0 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC158Q5M9N0 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC158Q5M9N0 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC158Q5M9N0 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC158Q5M9N0 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC158Q5M9N0 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC158Q5M9N0 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC158Q5M9N0 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC158Q5M9N0 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC158Q5M9N0 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC158Q5M9N0 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC158Q5M9N0 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC158Q5M9N0 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC158Q5M9N0 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC158Q5M9N0 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC158Q5M9N0 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC158Q5M9N0 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC158Q5M9N0 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC158Q5M9N0 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC158Q5M9N0 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC158Q5M9N0 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC158Q5M9N0 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CCDC158Q5M9N0 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
CCDC158Q5M9N0 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CCDC158Q5M9N0 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC158Q5M9N0 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC158Q5M9N0 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC158Q5M9N0 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC158Q5M9N0 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC158Q5M9N0 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC158Q5M9N0 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC158Q5M9N0 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC158Q5M9N0 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC158Q5M9N0 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC158Q5M9N0 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC158Q5M9N0 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC158Q5M9N0 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC158Q5M9N0 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC158Q5M9N0 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC158Q5M9N0 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC158Q5M9N0 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC158Q5M9N0 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC158Q5M9N0 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC158Q5M9N0 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC158Q5M9N0 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC158Q5M9N0 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC158Q5M9N0 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC158Q5M9N0 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC158Q5M9N0 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC158Q5M9N0 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC158Q5M9N0 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC158Q5M9N0 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC158Q5M9N0 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC158Q5M9N0 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC158Q5M9N0 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC158Q5M9N0 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC158Q5M9N0 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC158Q5M9N0 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC158Q5M9N0 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC158Q5M9N0 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC158Q5M9N0 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC158Q5M9N0 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC158Q5M9N0 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC158Q5M9N0 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms