Protein–RNA interactions for Protein: Q5BJF6

ODF2, Outer dense fiber protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 829 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF2Q5BJF6 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ODF2Q5BJF6 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ODF2Q5BJF6 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ODF2Q5BJF6 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ODF2Q5BJF6 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ODF2Q5BJF6 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ODF2Q5BJF6 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ODF2Q5BJF6 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ODF2Q5BJF6 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ODF2Q5BJF6 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ODF2Q5BJF6 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ODF2Q5BJF6 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ODF2Q5BJF6 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ODF2Q5BJF6 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ODF2Q5BJF6 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ODF2Q5BJF6 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ODF2Q5BJF6 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ODF2Q5BJF6 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ODF2Q5BJF6 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ODF2Q5BJF6 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ODF2Q5BJF6 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ODF2Q5BJF6 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ODF2Q5BJF6 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ODF2Q5BJF6 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ODF2Q5BJF6 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ODF2Q5BJF6 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ODF2Q5BJF6 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ODF2Q5BJF6 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ODF2Q5BJF6 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ODF2Q5BJF6 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ODF2Q5BJF6 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ODF2Q5BJF6 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ODF2Q5BJF6 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ODF2Q5BJF6 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ODF2Q5BJF6 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ODF2Q5BJF6 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ODF2Q5BJF6 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ODF2Q5BJF6 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ODF2Q5BJF6 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ODF2Q5BJF6 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ODF2Q5BJF6 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ODF2Q5BJF6 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ODF2Q5BJF6 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ODF2Q5BJF6 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ODF2Q5BJF6 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ODF2Q5BJF6 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ODF2Q5BJF6 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ODF2Q5BJF6 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ODF2Q5BJF6 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ODF2Q5BJF6 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ODF2Q5BJF6 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ODF2Q5BJF6 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ODF2Q5BJF6 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ODF2Q5BJF6 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ODF2Q5BJF6 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ODF2Q5BJF6 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ODF2Q5BJF6 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
ODF2Q5BJF6 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ODF2Q5BJF6 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ODF2Q5BJF6 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ODF2Q5BJF6 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ODF2Q5BJF6 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ODF2Q5BJF6 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ODF2Q5BJF6 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ODF2Q5BJF6 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ODF2Q5BJF6 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ODF2Q5BJF6 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ODF2Q5BJF6 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ODF2Q5BJF6 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ODF2Q5BJF6 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ODF2Q5BJF6 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ODF2Q5BJF6 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ODF2Q5BJF6 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ODF2Q5BJF6 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ODF2Q5BJF6 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ODF2Q5BJF6 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ODF2Q5BJF6 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ODF2Q5BJF6 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ODF2Q5BJF6 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ODF2Q5BJF6 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ODF2Q5BJF6 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ODF2Q5BJF6 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
ODF2Q5BJF6 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
ODF2Q5BJF6 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ODF2Q5BJF6 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ODF2Q5BJF6 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ODF2Q5BJF6 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ODF2Q5BJF6 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ODF2Q5BJF6 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ODF2Q5BJF6 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ODF2Q5BJF6 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ODF2Q5BJF6 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ODF2Q5BJF6 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ODF2Q5BJF6 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ODF2Q5BJF6 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ODF2Q5BJF6 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ODF2Q5BJF6 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ODF2Q5BJF6 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ODF2Q5BJF6 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ODF2Q5BJF6 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms