Protein–RNA interactions for Protein: Q567U6

CCDC93, Coiled-coil domain-containing protein 93, humanhuman

Predictions only

Length 631 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC93Q567U6 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC93Q567U6 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC93Q567U6 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC93Q567U6 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC93Q567U6 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC93Q567U6 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC93Q567U6 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC93Q567U6 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC93Q567U6 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC93Q567U6 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC93Q567U6 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC93Q567U6 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC93Q567U6 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC93Q567U6 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC93Q567U6 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC93Q567U6 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC93Q567U6 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC93Q567U6 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC93Q567U6 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC93Q567U6 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC93Q567U6 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC93Q567U6 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC93Q567U6 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC93Q567U6 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC93Q567U6 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC93Q567U6 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC93Q567U6 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC93Q567U6 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC93Q567U6 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC93Q567U6 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC93Q567U6 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC93Q567U6 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC93Q567U6 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC93Q567U6 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC93Q567U6 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC93Q567U6 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC93Q567U6 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC93Q567U6 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC93Q567U6 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC93Q567U6 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.31
CCDC93Q567U6 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC93Q567U6 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC93Q567U6 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC93Q567U6 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC93Q567U6 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC93Q567U6 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC93Q567U6 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC93Q567U6 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC93Q567U6 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC93Q567U6 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC93Q567U6 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC93Q567U6 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC93Q567U6 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC93Q567U6 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC93Q567U6 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC93Q567U6 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC93Q567U6 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC93Q567U6 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC93Q567U6 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC93Q567U6 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC93Q567U6 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC93Q567U6 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC93Q567U6 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC93Q567U6 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC93Q567U6 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC93Q567U6 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC93Q567U6 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC93Q567U6 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC93Q567U6 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC93Q567U6 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC93Q567U6 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC93Q567U6 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC93Q567U6 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC93Q567U6 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC93Q567U6 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC93Q567U6 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC93Q567U6 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC93Q567U6 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC93Q567U6 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC93Q567U6 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC93Q567U6 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC93Q567U6 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC93Q567U6 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC93Q567U6 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC93Q567U6 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC93Q567U6 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC93Q567U6 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC93Q567U6 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC93Q567U6 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC93Q567U6 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC93Q567U6 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC93Q567U6 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC93Q567U6 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC93Q567U6 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC93Q567U6 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC93Q567U6 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC93Q567U6 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC93Q567U6 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC93Q567U6 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC93Q567U6 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms