Protein–RNA interactions for Protein: Q53FE4

C4orf17, Uncharacterized protein C4orf17, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf17Q53FE4 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
C4orf17Q53FE4 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
C4orf17Q53FE4 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
C4orf17Q53FE4 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
C4orf17Q53FE4 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
C4orf17Q53FE4 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
C4orf17Q53FE4 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
C4orf17Q53FE4 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
C4orf17Q53FE4 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
C4orf17Q53FE4 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
C4orf17Q53FE4 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
C4orf17Q53FE4 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
C4orf17Q53FE4 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
C4orf17Q53FE4 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
C4orf17Q53FE4 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
C4orf17Q53FE4 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
C4orf17Q53FE4 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
C4orf17Q53FE4 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
C4orf17Q53FE4 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
C4orf17Q53FE4 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
C4orf17Q53FE4 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
C4orf17Q53FE4 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
C4orf17Q53FE4 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
C4orf17Q53FE4 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
C4orf17Q53FE4 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
C4orf17Q53FE4 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
C4orf17Q53FE4 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
C4orf17Q53FE4 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
C4orf17Q53FE4 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
C4orf17Q53FE4 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
C4orf17Q53FE4 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
C4orf17Q53FE4 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
C4orf17Q53FE4 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
C4orf17Q53FE4 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
C4orf17Q53FE4 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
C4orf17Q53FE4 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
C4orf17Q53FE4 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
C4orf17Q53FE4 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
C4orf17Q53FE4 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
C4orf17Q53FE4 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
C4orf17Q53FE4 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
C4orf17Q53FE4 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
C4orf17Q53FE4 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
C4orf17Q53FE4 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
C4orf17Q53FE4 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
C4orf17Q53FE4 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
C4orf17Q53FE4 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
C4orf17Q53FE4 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
C4orf17Q53FE4 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
C4orf17Q53FE4 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
C4orf17Q53FE4 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
C4orf17Q53FE4 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
C4orf17Q53FE4 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
C4orf17Q53FE4 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
C4orf17Q53FE4 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
C4orf17Q53FE4 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
C4orf17Q53FE4 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
C4orf17Q53FE4 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.32
C4orf17Q53FE4 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
C4orf17Q53FE4 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
C4orf17Q53FE4 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
C4orf17Q53FE4 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
C4orf17Q53FE4 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
C4orf17Q53FE4 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
C4orf17Q53FE4 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
C4orf17Q53FE4 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
C4orf17Q53FE4 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
C4orf17Q53FE4 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
C4orf17Q53FE4 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
C4orf17Q53FE4 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
C4orf17Q53FE4 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.31
C4orf17Q53FE4 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
C4orf17Q53FE4 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
C4orf17Q53FE4 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
C4orf17Q53FE4 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
C4orf17Q53FE4 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
C4orf17Q53FE4 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
C4orf17Q53FE4 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
C4orf17Q53FE4 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
C4orf17Q53FE4 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
C4orf17Q53FE4 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
C4orf17Q53FE4 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
C4orf17Q53FE4 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
C4orf17Q53FE4 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
C4orf17Q53FE4 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
C4orf17Q53FE4 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
C4orf17Q53FE4 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
C4orf17Q53FE4 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
C4orf17Q53FE4 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
C4orf17Q53FE4 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
C4orf17Q53FE4 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
C4orf17Q53FE4 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
C4orf17Q53FE4 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
C4orf17Q53FE4 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
C4orf17Q53FE4 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
C4orf17Q53FE4 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
C4orf17Q53FE4 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
C4orf17Q53FE4 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
C4orf17Q53FE4 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
C4orf17Q53FE4 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms