Protein–RNA interactions for Protein: Q4VX76

SYTL3, Synaptotagmin-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 610 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYTL3Q4VX76 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SYTL3Q4VX76 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SYTL3Q4VX76 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
SYTL3Q4VX76 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SYTL3Q4VX76 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SYTL3Q4VX76 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SYTL3Q4VX76 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SYTL3Q4VX76 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SYTL3Q4VX76 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
SYTL3Q4VX76 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SYTL3Q4VX76 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SYTL3Q4VX76 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SYTL3Q4VX76 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SYTL3Q4VX76 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SYTL3Q4VX76 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SYTL3Q4VX76 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SYTL3Q4VX76 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SYTL3Q4VX76 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SYTL3Q4VX76 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SYTL3Q4VX76 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SYTL3Q4VX76 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SYTL3Q4VX76 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SYTL3Q4VX76 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SYTL3Q4VX76 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SYTL3Q4VX76 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SYTL3Q4VX76 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SYTL3Q4VX76 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SYTL3Q4VX76 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SYTL3Q4VX76 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SYTL3Q4VX76 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SYTL3Q4VX76 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SYTL3Q4VX76 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SYTL3Q4VX76 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SYTL3Q4VX76 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SYTL3Q4VX76 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
SYTL3Q4VX76 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SYTL3Q4VX76 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SYTL3Q4VX76 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SYTL3Q4VX76 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SYTL3Q4VX76 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SYTL3Q4VX76 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SYTL3Q4VX76 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SYTL3Q4VX76 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SYTL3Q4VX76 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SYTL3Q4VX76 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SYTL3Q4VX76 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SYTL3Q4VX76 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SYTL3Q4VX76 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SYTL3Q4VX76 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
SYTL3Q4VX76 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SYTL3Q4VX76 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SYTL3Q4VX76 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SYTL3Q4VX76 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SYTL3Q4VX76 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SYTL3Q4VX76 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SYTL3Q4VX76 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SYTL3Q4VX76 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SYTL3Q4VX76 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SYTL3Q4VX76 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SYTL3Q4VX76 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SYTL3Q4VX76 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SYTL3Q4VX76 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SYTL3Q4VX76 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
SYTL3Q4VX76 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SYTL3Q4VX76 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
SYTL3Q4VX76 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
SYTL3Q4VX76 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SYTL3Q4VX76 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SYTL3Q4VX76 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
SYTL3Q4VX76 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SYTL3Q4VX76 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
SYTL3Q4VX76 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
SYTL3Q4VX76 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SYTL3Q4VX76 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SYTL3Q4VX76 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SYTL3Q4VX76 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SYTL3Q4VX76 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SYTL3Q4VX76 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SYTL3Q4VX76 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SYTL3Q4VX76 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SYTL3Q4VX76 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SYTL3Q4VX76 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SYTL3Q4VX76 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SYTL3Q4VX76 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SYTL3Q4VX76 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SYTL3Q4VX76 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SYTL3Q4VX76 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SYTL3Q4VX76 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SYTL3Q4VX76 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SYTL3Q4VX76 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SYTL3Q4VX76 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SYTL3Q4VX76 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SYTL3Q4VX76 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SYTL3Q4VX76 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SYTL3Q4VX76 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SYTL3Q4VX76 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SYTL3Q4VX76 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SYTL3Q4VX76 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SYTL3Q4VX76 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SYTL3Q4VX76 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms