Protein–RNA interactions for Protein: Q4KMQ1

TPRN, Taperin, humanhuman

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Length 711 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPRNQ4KMQ1 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TPRNQ4KMQ1 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TPRNQ4KMQ1 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TPRNQ4KMQ1 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
TPRNQ4KMQ1 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TPRNQ4KMQ1 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TPRNQ4KMQ1 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TPRNQ4KMQ1 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TPRNQ4KMQ1 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TPRNQ4KMQ1 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TPRNQ4KMQ1 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TPRNQ4KMQ1 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TPRNQ4KMQ1 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TPRNQ4KMQ1 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TPRNQ4KMQ1 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TPRNQ4KMQ1 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TPRNQ4KMQ1 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TPRNQ4KMQ1 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TPRNQ4KMQ1 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TPRNQ4KMQ1 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TPRNQ4KMQ1 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TPRNQ4KMQ1 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TPRNQ4KMQ1 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TPRNQ4KMQ1 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TPRNQ4KMQ1 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TPRNQ4KMQ1 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TPRNQ4KMQ1 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TPRNQ4KMQ1 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TPRNQ4KMQ1 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TPRNQ4KMQ1 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TPRNQ4KMQ1 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TPRNQ4KMQ1 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TPRNQ4KMQ1 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TPRNQ4KMQ1 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
TPRNQ4KMQ1 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TPRNQ4KMQ1 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TPRNQ4KMQ1 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TPRNQ4KMQ1 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TPRNQ4KMQ1 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TPRNQ4KMQ1 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TPRNQ4KMQ1 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TPRNQ4KMQ1 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TPRNQ4KMQ1 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TPRNQ4KMQ1 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
TPRNQ4KMQ1 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
TPRNQ4KMQ1 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
TPRNQ4KMQ1 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TPRNQ4KMQ1 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TPRNQ4KMQ1 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TPRNQ4KMQ1 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TPRNQ4KMQ1 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TPRNQ4KMQ1 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TPRNQ4KMQ1 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TPRNQ4KMQ1 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TPRNQ4KMQ1 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TPRNQ4KMQ1 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TPRNQ4KMQ1 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TPRNQ4KMQ1 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TPRNQ4KMQ1 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TPRNQ4KMQ1 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TPRNQ4KMQ1 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
TPRNQ4KMQ1 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TPRNQ4KMQ1 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TPRNQ4KMQ1 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TPRNQ4KMQ1 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TPRNQ4KMQ1 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TPRNQ4KMQ1 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TPRNQ4KMQ1 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TPRNQ4KMQ1 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TPRNQ4KMQ1 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TPRNQ4KMQ1 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TPRNQ4KMQ1 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TPRNQ4KMQ1 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TPRNQ4KMQ1 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TPRNQ4KMQ1 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TPRNQ4KMQ1 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TPRNQ4KMQ1 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TPRNQ4KMQ1 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TPRNQ4KMQ1 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
TPRNQ4KMQ1 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TPRNQ4KMQ1 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TPRNQ4KMQ1 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TPRNQ4KMQ1 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TPRNQ4KMQ1 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TPRNQ4KMQ1 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TPRNQ4KMQ1 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TPRNQ4KMQ1 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TPRNQ4KMQ1 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TPRNQ4KMQ1 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
TPRNQ4KMQ1 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TPRNQ4KMQ1 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TPRNQ4KMQ1 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TPRNQ4KMQ1 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TPRNQ4KMQ1 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TPRNQ4KMQ1 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TPRNQ4KMQ1 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TPRNQ4KMQ1 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TPRNQ4KMQ1 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TPRNQ4KMQ1 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TPRNQ4KMQ1 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
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