Protein–RNA interactions for Protein: Q4G0W2

DUSP28, Dual specificity phosphatase 28, humanhuman

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP28Q4G0W2 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
DUSP28Q4G0W2 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
DUSP28Q4G0W2 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
DUSP28Q4G0W2 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
DUSP28Q4G0W2 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
DUSP28Q4G0W2 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
DUSP28Q4G0W2 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
DUSP28Q4G0W2 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
DUSP28Q4G0W2 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
DUSP28Q4G0W2 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
DUSP28Q4G0W2 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
DUSP28Q4G0W2 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
DUSP28Q4G0W2 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
DUSP28Q4G0W2 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
DUSP28Q4G0W2 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
DUSP28Q4G0W2 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
DUSP28Q4G0W2 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
DUSP28Q4G0W2 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
DUSP28Q4G0W2 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
DUSP28Q4G0W2 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
DUSP28Q4G0W2 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
DUSP28Q4G0W2 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
DUSP28Q4G0W2 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
DUSP28Q4G0W2 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
DUSP28Q4G0W2 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
DUSP28Q4G0W2 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
DUSP28Q4G0W2 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
DUSP28Q4G0W2 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
DUSP28Q4G0W2 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
DUSP28Q4G0W2 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
DUSP28Q4G0W2 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
DUSP28Q4G0W2 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
DUSP28Q4G0W2 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
DUSP28Q4G0W2 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
DUSP28Q4G0W2 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
DUSP28Q4G0W2 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
DUSP28Q4G0W2 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
DUSP28Q4G0W2 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
DUSP28Q4G0W2 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
DUSP28Q4G0W2 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
DUSP28Q4G0W2 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
DUSP28Q4G0W2 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
DUSP28Q4G0W2 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
DUSP28Q4G0W2 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
DUSP28Q4G0W2 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
DUSP28Q4G0W2 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
DUSP28Q4G0W2 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
DUSP28Q4G0W2 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
DUSP28Q4G0W2 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
DUSP28Q4G0W2 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
DUSP28Q4G0W2 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
DUSP28Q4G0W2 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
DUSP28Q4G0W2 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
DUSP28Q4G0W2 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
DUSP28Q4G0W2 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
DUSP28Q4G0W2 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
DUSP28Q4G0W2 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
DUSP28Q4G0W2 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
DUSP28Q4G0W2 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
DUSP28Q4G0W2 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
DUSP28Q4G0W2 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
DUSP28Q4G0W2 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
DUSP28Q4G0W2 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
DUSP28Q4G0W2 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
DUSP28Q4G0W2 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
DUSP28Q4G0W2 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
DUSP28Q4G0W2 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
DUSP28Q4G0W2 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
DUSP28Q4G0W2 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
DUSP28Q4G0W2 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
DUSP28Q4G0W2 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
DUSP28Q4G0W2 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
DUSP28Q4G0W2 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
DUSP28Q4G0W2 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
DUSP28Q4G0W2 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
DUSP28Q4G0W2 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
DUSP28Q4G0W2 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
DUSP28Q4G0W2 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
DUSP28Q4G0W2 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
DUSP28Q4G0W2 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
DUSP28Q4G0W2 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
DUSP28Q4G0W2 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
DUSP28Q4G0W2 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
DUSP28Q4G0W2 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
DUSP28Q4G0W2 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
DUSP28Q4G0W2 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
DUSP28Q4G0W2 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
DUSP28Q4G0W2 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
DUSP28Q4G0W2 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
DUSP28Q4G0W2 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
DUSP28Q4G0W2 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
DUSP28Q4G0W2 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
DUSP28Q4G0W2 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
DUSP28Q4G0W2 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
DUSP28Q4G0W2 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC21.06■□□□□ 0.96
DUSP28Q4G0W2 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
DUSP28Q4G0W2 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
DUSP28Q4G0W2 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
DUSP28Q4G0W2 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
DUSP28Q4G0W2 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.8 ms