Protein–RNA interactions for Protein: Q2TBA0

KLHL40, Kelch-like protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL40Q2TBA0 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
KLHL40Q2TBA0 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
KLHL40Q2TBA0 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
KLHL40Q2TBA0 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC21.76■■□□□ 1.07
KLHL40Q2TBA0 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
KLHL40Q2TBA0 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
KLHL40Q2TBA0 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
KLHL40Q2TBA0 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
KLHL40Q2TBA0 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
KLHL40Q2TBA0 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
KLHL40Q2TBA0 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
KLHL40Q2TBA0 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
KLHL40Q2TBA0 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
KLHL40Q2TBA0 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
KLHL40Q2TBA0 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
KLHL40Q2TBA0 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
KLHL40Q2TBA0 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
KLHL40Q2TBA0 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
KLHL40Q2TBA0 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
KLHL40Q2TBA0 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
KLHL40Q2TBA0 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
KLHL40Q2TBA0 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
KLHL40Q2TBA0 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
KLHL40Q2TBA0 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
KLHL40Q2TBA0 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
KLHL40Q2TBA0 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
KLHL40Q2TBA0 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
KLHL40Q2TBA0 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
KLHL40Q2TBA0 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
KLHL40Q2TBA0 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
KLHL40Q2TBA0 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
KLHL40Q2TBA0 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
KLHL40Q2TBA0 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
KLHL40Q2TBA0 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
KLHL40Q2TBA0 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
KLHL40Q2TBA0 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
KLHL40Q2TBA0 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
KLHL40Q2TBA0 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
KLHL40Q2TBA0 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
KLHL40Q2TBA0 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
KLHL40Q2TBA0 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
KLHL40Q2TBA0 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
KLHL40Q2TBA0 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
KLHL40Q2TBA0 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
KLHL40Q2TBA0 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
KLHL40Q2TBA0 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
KLHL40Q2TBA0 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
KLHL40Q2TBA0 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
KLHL40Q2TBA0 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
KLHL40Q2TBA0 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
KLHL40Q2TBA0 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
KLHL40Q2TBA0 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
KLHL40Q2TBA0 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
KLHL40Q2TBA0 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC21.74■■□□□ 1.07
KLHL40Q2TBA0 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
KLHL40Q2TBA0 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
KLHL40Q2TBA0 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
KLHL40Q2TBA0 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
KLHL40Q2TBA0 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
KLHL40Q2TBA0 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
KLHL40Q2TBA0 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
KLHL40Q2TBA0 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
KLHL40Q2TBA0 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
KLHL40Q2TBA0 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
KLHL40Q2TBA0 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
KLHL40Q2TBA0 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
KLHL40Q2TBA0 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
KLHL40Q2TBA0 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
KLHL40Q2TBA0 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
KLHL40Q2TBA0 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
KLHL40Q2TBA0 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
KLHL40Q2TBA0 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
KLHL40Q2TBA0 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
KLHL40Q2TBA0 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
KLHL40Q2TBA0 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
KLHL40Q2TBA0 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
KLHL40Q2TBA0 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
KLHL40Q2TBA0 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
KLHL40Q2TBA0 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC21.73■■□□□ 1.07
KLHL40Q2TBA0 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
KLHL40Q2TBA0 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
KLHL40Q2TBA0 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
KLHL40Q2TBA0 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
KLHL40Q2TBA0 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
KLHL40Q2TBA0 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
KLHL40Q2TBA0 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
KLHL40Q2TBA0 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
KLHL40Q2TBA0 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
KLHL40Q2TBA0 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
KLHL40Q2TBA0 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
KLHL40Q2TBA0 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
KLHL40Q2TBA0 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
KLHL40Q2TBA0 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
KLHL40Q2TBA0 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
KLHL40Q2TBA0 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
KLHL40Q2TBA0 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
KLHL40Q2TBA0 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
KLHL40Q2TBA0 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
KLHL40Q2TBA0 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
KLHL40Q2TBA0 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.7 ms