Protein–RNA interactions for Protein: Q1L6U9

MSMP, Prostate-associated microseminoprotein, humanhuman

Predictions only

Length 139 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSMPQ1L6U9 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
MSMPQ1L6U9 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
MSMPQ1L6U9 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MSMPQ1L6U9 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MSMPQ1L6U9 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MSMPQ1L6U9 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MSMPQ1L6U9 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MSMPQ1L6U9 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
MSMPQ1L6U9 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
MSMPQ1L6U9 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
MSMPQ1L6U9 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
MSMPQ1L6U9 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MSMPQ1L6U9 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MSMPQ1L6U9 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MSMPQ1L6U9 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MSMPQ1L6U9 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MSMPQ1L6U9 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MSMPQ1L6U9 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MSMPQ1L6U9 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MSMPQ1L6U9 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
MSMPQ1L6U9 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MSMPQ1L6U9 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MSMPQ1L6U9 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MSMPQ1L6U9 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
MSMPQ1L6U9 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
MSMPQ1L6U9 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MSMPQ1L6U9 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MSMPQ1L6U9 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MSMPQ1L6U9 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MSMPQ1L6U9 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MSMPQ1L6U9 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
MSMPQ1L6U9 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MSMPQ1L6U9 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MSMPQ1L6U9 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MSMPQ1L6U9 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MSMPQ1L6U9 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MSMPQ1L6U9 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MSMPQ1L6U9 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MSMPQ1L6U9 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MSMPQ1L6U9 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MSMPQ1L6U9 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MSMPQ1L6U9 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
MSMPQ1L6U9 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MSMPQ1L6U9 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MSMPQ1L6U9 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MSMPQ1L6U9 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MSMPQ1L6U9 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MSMPQ1L6U9 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MSMPQ1L6U9 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MSMPQ1L6U9 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MSMPQ1L6U9 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MSMPQ1L6U9 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MSMPQ1L6U9 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MSMPQ1L6U9 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MSMPQ1L6U9 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MSMPQ1L6U9 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MSMPQ1L6U9 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MSMPQ1L6U9 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MSMPQ1L6U9 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MSMPQ1L6U9 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
MSMPQ1L6U9 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
MSMPQ1L6U9 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MSMPQ1L6U9 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MSMPQ1L6U9 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MSMPQ1L6U9 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MSMPQ1L6U9 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MSMPQ1L6U9 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MSMPQ1L6U9 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MSMPQ1L6U9 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
MSMPQ1L6U9 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MSMPQ1L6U9 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MSMPQ1L6U9 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MSMPQ1L6U9 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MSMPQ1L6U9 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MSMPQ1L6U9 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MSMPQ1L6U9 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MSMPQ1L6U9 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MSMPQ1L6U9 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MSMPQ1L6U9 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MSMPQ1L6U9 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MSMPQ1L6U9 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MSMPQ1L6U9 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MSMPQ1L6U9 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MSMPQ1L6U9 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MSMPQ1L6U9 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MSMPQ1L6U9 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
MSMPQ1L6U9 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MSMPQ1L6U9 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MSMPQ1L6U9 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MSMPQ1L6U9 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MSMPQ1L6U9 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MSMPQ1L6U9 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MSMPQ1L6U9 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MSMPQ1L6U9 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MSMPQ1L6U9 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MSMPQ1L6U9 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MSMPQ1L6U9 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MSMPQ1L6U9 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
MSMPQ1L6U9 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MSMPQ1L6U9 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms