Protein–RNA interactions for Protein: Q16799

RTN1, Reticulon-1, humanhuman

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Length 776 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTN1Q16799 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RTN1Q16799 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RTN1Q16799 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RTN1Q16799 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RTN1Q16799 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RTN1Q16799 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
RTN1Q16799 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RTN1Q16799 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
RTN1Q16799 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
RTN1Q16799 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
RTN1Q16799 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
RTN1Q16799 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RTN1Q16799 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RTN1Q16799 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RTN1Q16799 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RTN1Q16799 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RTN1Q16799 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RTN1Q16799 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RTN1Q16799 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RTN1Q16799 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RTN1Q16799 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RTN1Q16799 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RTN1Q16799 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RTN1Q16799 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RTN1Q16799 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RTN1Q16799 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RTN1Q16799 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RTN1Q16799 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RTN1Q16799 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RTN1Q16799 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
RTN1Q16799 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RTN1Q16799 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RTN1Q16799 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RTN1Q16799 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RTN1Q16799 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RTN1Q16799 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
RTN1Q16799 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RTN1Q16799 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RTN1Q16799 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RTN1Q16799 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RTN1Q16799 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RTN1Q16799 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RTN1Q16799 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RTN1Q16799 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RTN1Q16799 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RTN1Q16799 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RTN1Q16799 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RTN1Q16799 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RTN1Q16799 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RTN1Q16799 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RTN1Q16799 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RTN1Q16799 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RTN1Q16799 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RTN1Q16799 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RTN1Q16799 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RTN1Q16799 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RTN1Q16799 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RTN1Q16799 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RTN1Q16799 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RTN1Q16799 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RTN1Q16799 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RTN1Q16799 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RTN1Q16799 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RTN1Q16799 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RTN1Q16799 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RTN1Q16799 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RTN1Q16799 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RTN1Q16799 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RTN1Q16799 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RTN1Q16799 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RTN1Q16799 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RTN1Q16799 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RTN1Q16799 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RTN1Q16799 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RTN1Q16799 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RTN1Q16799 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RTN1Q16799 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RTN1Q16799 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RTN1Q16799 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RTN1Q16799 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RTN1Q16799 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RTN1Q16799 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RTN1Q16799 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RTN1Q16799 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RTN1Q16799 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RTN1Q16799 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RTN1Q16799 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RTN1Q16799 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RTN1Q16799 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RTN1Q16799 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
RTN1Q16799 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RTN1Q16799 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RTN1Q16799 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RTN1Q16799 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RTN1Q16799 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RTN1Q16799 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RTN1Q16799 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RTN1Q16799 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RTN1Q16799 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RTN1Q16799 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
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