Protein–RNA interactions for Protein: Q16720

ATP2B3, Plasma membrane calcium-transporting ATPase 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2B3Q16720 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATP2B3Q16720 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATP2B3Q16720 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATP2B3Q16720 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATP2B3Q16720 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATP2B3Q16720 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATP2B3Q16720 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATP2B3Q16720 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATP2B3Q16720 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATP2B3Q16720 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATP2B3Q16720 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATP2B3Q16720 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATP2B3Q16720 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATP2B3Q16720 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATP2B3Q16720 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATP2B3Q16720 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATP2B3Q16720 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATP2B3Q16720 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATP2B3Q16720 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATP2B3Q16720 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATP2B3Q16720 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATP2B3Q16720 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATP2B3Q16720 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATP2B3Q16720 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATP2B3Q16720 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATP2B3Q16720 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATP2B3Q16720 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATP2B3Q16720 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATP2B3Q16720 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATP2B3Q16720 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
ATP2B3Q16720 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATP2B3Q16720 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATP2B3Q16720 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
ATP2B3Q16720 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATP2B3Q16720 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATP2B3Q16720 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
ATP2B3Q16720 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATP2B3Q16720 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATP2B3Q16720 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATP2B3Q16720 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
ATP2B3Q16720 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATP2B3Q16720 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATP2B3Q16720 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATP2B3Q16720 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATP2B3Q16720 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
ATP2B3Q16720 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATP2B3Q16720 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATP2B3Q16720 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATP2B3Q16720 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATP2B3Q16720 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATP2B3Q16720 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATP2B3Q16720 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATP2B3Q16720 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATP2B3Q16720 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATP2B3Q16720 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATP2B3Q16720 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATP2B3Q16720 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATP2B3Q16720 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATP2B3Q16720 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATP2B3Q16720 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATP2B3Q16720 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATP2B3Q16720 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
ATP2B3Q16720 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
ATP2B3Q16720 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
ATP2B3Q16720 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
ATP2B3Q16720 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATP2B3Q16720 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATP2B3Q16720 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATP2B3Q16720 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATP2B3Q16720 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATP2B3Q16720 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
ATP2B3Q16720 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
ATP2B3Q16720 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATP2B3Q16720 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
ATP2B3Q16720 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATP2B3Q16720 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATP2B3Q16720 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATP2B3Q16720 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATP2B3Q16720 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATP2B3Q16720 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATP2B3Q16720 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATP2B3Q16720 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATP2B3Q16720 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATP2B3Q16720 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATP2B3Q16720 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
ATP2B3Q16720 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATP2B3Q16720 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATP2B3Q16720 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATP2B3Q16720 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATP2B3Q16720 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATP2B3Q16720 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATP2B3Q16720 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
ATP2B3Q16720 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
ATP2B3Q16720 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATP2B3Q16720 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATP2B3Q16720 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATP2B3Q16720 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATP2B3Q16720 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATP2B3Q16720 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATP2B3Q16720 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
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