Protein–RNA interactions for Protein: Q16658

FSCN1, Fascin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 493 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FSCN1Q16658 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
FSCN1Q16658 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
FSCN1Q16658 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
FSCN1Q16658 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
FSCN1Q16658 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
FSCN1Q16658 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
FSCN1Q16658 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
FSCN1Q16658 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
FSCN1Q16658 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
FSCN1Q16658 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
FSCN1Q16658 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
FSCN1Q16658 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
FSCN1Q16658 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
FSCN1Q16658 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
FSCN1Q16658 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
FSCN1Q16658 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
FSCN1Q16658 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
FSCN1Q16658 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
FSCN1Q16658 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
FSCN1Q16658 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
FSCN1Q16658 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
FSCN1Q16658 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
FSCN1Q16658 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
FSCN1Q16658 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
FSCN1Q16658 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
FSCN1Q16658 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
FSCN1Q16658 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
FSCN1Q16658 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
FSCN1Q16658 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
FSCN1Q16658 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
FSCN1Q16658 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
FSCN1Q16658 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
FSCN1Q16658 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
FSCN1Q16658 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
FSCN1Q16658 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
FSCN1Q16658 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
FSCN1Q16658 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
FSCN1Q16658 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC21.02■□□□□ 0.95
FSCN1Q16658 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
FSCN1Q16658 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
FSCN1Q16658 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
FSCN1Q16658 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
FSCN1Q16658 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
FSCN1Q16658 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
FSCN1Q16658 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC21.01■□□□□ 0.95
FSCN1Q16658 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
FSCN1Q16658 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
FSCN1Q16658 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
FSCN1Q16658 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
FSCN1Q16658 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
FSCN1Q16658 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
FSCN1Q16658 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
FSCN1Q16658 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
FSCN1Q16658 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
FSCN1Q16658 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
FSCN1Q16658 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC21.01■□□□□ 0.95
FSCN1Q16658 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
FSCN1Q16658 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
FSCN1Q16658 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
FSCN1Q16658 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
FSCN1Q16658 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
FSCN1Q16658 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
FSCN1Q16658 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
FSCN1Q16658 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
FSCN1Q16658 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
FSCN1Q16658 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
FSCN1Q16658 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
FSCN1Q16658 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
FSCN1Q16658 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
FSCN1Q16658 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
FSCN1Q16658 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
FSCN1Q16658 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
FSCN1Q16658 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21■□□□□ 0.95
FSCN1Q16658 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
FSCN1Q16658 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
FSCN1Q16658 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
FSCN1Q16658 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
FSCN1Q16658 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
FSCN1Q16658 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
FSCN1Q16658 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
FSCN1Q16658 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
FSCN1Q16658 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
FSCN1Q16658 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
FSCN1Q16658 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
FSCN1Q16658 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
FSCN1Q16658 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
FSCN1Q16658 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
FSCN1Q16658 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
FSCN1Q16658 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
FSCN1Q16658 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
FSCN1Q16658 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
FSCN1Q16658 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
FSCN1Q16658 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
FSCN1Q16658 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
FSCN1Q16658 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
FSCN1Q16658 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
FSCN1Q16658 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.99■□□□□ 0.95
FSCN1Q16658 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
FSCN1Q16658 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
FSCN1Q16658 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms