Protein–RNA interactions for Protein: Q16363

LAMA4, Laminin subunit alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,823 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA4Q16363 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LAMA4Q16363 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
LAMA4Q16363 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LAMA4Q16363 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LAMA4Q16363 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
LAMA4Q16363 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LAMA4Q16363 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LAMA4Q16363 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LAMA4Q16363 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LAMA4Q16363 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LAMA4Q16363 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LAMA4Q16363 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LAMA4Q16363 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LAMA4Q16363 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LAMA4Q16363 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LAMA4Q16363 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LAMA4Q16363 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LAMA4Q16363 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LAMA4Q16363 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LAMA4Q16363 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LAMA4Q16363 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LAMA4Q16363 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LAMA4Q16363 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LAMA4Q16363 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LAMA4Q16363 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
LAMA4Q16363 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LAMA4Q16363 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LAMA4Q16363 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LAMA4Q16363 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LAMA4Q16363 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LAMA4Q16363 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LAMA4Q16363 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LAMA4Q16363 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LAMA4Q16363 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
LAMA4Q16363 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
LAMA4Q16363 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
LAMA4Q16363 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.16
LAMA4Q16363 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.16
LAMA4Q16363 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
LAMA4Q16363 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
LAMA4Q16363 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
LAMA4Q16363 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
LAMA4Q16363 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
LAMA4Q16363 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
LAMA4Q16363 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
LAMA4Q16363 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
LAMA4Q16363 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LAMA4Q16363 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LAMA4Q16363 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LAMA4Q16363 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LAMA4Q16363 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LAMA4Q16363 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LAMA4Q16363 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LAMA4Q16363 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LAMA4Q16363 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LAMA4Q16363 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LAMA4Q16363 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LAMA4Q16363 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LAMA4Q16363 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LAMA4Q16363 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LAMA4Q16363 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LAMA4Q16363 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LAMA4Q16363 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LAMA4Q16363 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LAMA4Q16363 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LAMA4Q16363 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LAMA4Q16363 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LAMA4Q16363 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LAMA4Q16363 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LAMA4Q16363 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LAMA4Q16363 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LAMA4Q16363 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LAMA4Q16363 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LAMA4Q16363 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LAMA4Q16363 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
LAMA4Q16363 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LAMA4Q16363 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LAMA4Q16363 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LAMA4Q16363 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LAMA4Q16363 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LAMA4Q16363 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LAMA4Q16363 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LAMA4Q16363 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LAMA4Q16363 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LAMA4Q16363 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LAMA4Q16363 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LAMA4Q16363 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LAMA4Q16363 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
LAMA4Q16363 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LAMA4Q16363 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
LAMA4Q16363 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LAMA4Q16363 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
LAMA4Q16363 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LAMA4Q16363 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LAMA4Q16363 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LAMA4Q16363 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LAMA4Q16363 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
LAMA4Q16363 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LAMA4Q16363 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LAMA4Q16363 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms