Protein–RNA interactions for Protein: Q16254

E2F4, Transcription factor E2F4, humanhuman

Predictions only

Length 413 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F4Q16254 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
E2F4Q16254 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
E2F4Q16254 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
E2F4Q16254 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
E2F4Q16254 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
E2F4Q16254 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
E2F4Q16254 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
E2F4Q16254 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
E2F4Q16254 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
E2F4Q16254 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
E2F4Q16254 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
E2F4Q16254 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
E2F4Q16254 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
E2F4Q16254 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
E2F4Q16254 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
E2F4Q16254 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
E2F4Q16254 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
E2F4Q16254 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
E2F4Q16254 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
E2F4Q16254 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
E2F4Q16254 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
E2F4Q16254 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
E2F4Q16254 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
E2F4Q16254 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
E2F4Q16254 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
E2F4Q16254 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
E2F4Q16254 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
E2F4Q16254 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
E2F4Q16254 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
E2F4Q16254 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
E2F4Q16254 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
E2F4Q16254 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
E2F4Q16254 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
E2F4Q16254 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
E2F4Q16254 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
E2F4Q16254 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
E2F4Q16254 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
E2F4Q16254 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
E2F4Q16254 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
E2F4Q16254 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
E2F4Q16254 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
E2F4Q16254 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
E2F4Q16254 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
E2F4Q16254 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
E2F4Q16254 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
E2F4Q16254 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
E2F4Q16254 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
E2F4Q16254 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
E2F4Q16254 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
E2F4Q16254 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
E2F4Q16254 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
E2F4Q16254 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
E2F4Q16254 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
E2F4Q16254 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
E2F4Q16254 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
E2F4Q16254 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
E2F4Q16254 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
E2F4Q16254 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
E2F4Q16254 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
E2F4Q16254 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
E2F4Q16254 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
E2F4Q16254 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
E2F4Q16254 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
E2F4Q16254 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
E2F4Q16254 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
E2F4Q16254 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
E2F4Q16254 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
E2F4Q16254 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
E2F4Q16254 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
E2F4Q16254 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
E2F4Q16254 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
E2F4Q16254 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
E2F4Q16254 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
E2F4Q16254 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
E2F4Q16254 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
E2F4Q16254 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
E2F4Q16254 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
E2F4Q16254 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
E2F4Q16254 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
E2F4Q16254 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
E2F4Q16254 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
E2F4Q16254 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
E2F4Q16254 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
E2F4Q16254 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
E2F4Q16254 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
E2F4Q16254 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
E2F4Q16254 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
E2F4Q16254 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
E2F4Q16254 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
E2F4Q16254 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
E2F4Q16254 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
E2F4Q16254 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
E2F4Q16254 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
E2F4Q16254 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
E2F4Q16254 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
E2F4Q16254 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
E2F4Q16254 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
E2F4Q16254 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
E2F4Q16254 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
E2F4Q16254 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms